本法較其他鑒定細菌的血清學方法速度快、操作簡單、敏感性高,但在細菌實驗診斷中,一般只能作為一種補充手段使用,而不能代替常規診斷。熒光抗體染色法對腦膜炎奈氏菌、痢疾志賀菌、霍亂弧菌、布氏桿菌和炭疽桿菌等的實驗診斷有較好效果。