熒光測量對許多生物學（葉綠素和類胡蘿卜素）、生物醫學（病變的熒光診斷）和環境監測是必要的測量手段。熒光測量通常需要高靈敏度的光譜儀(推薦使用AvaSpec-2048TEC，積分時間大于 5秒)。對于大多數熒光應用來說，產生的熒光能量只相當于激發光能量的3%左右。熒光的光子能量比激發光的光子能量要小（所以波長要長），而且一般都是散射光（在各個方向上輻射能量）。

對于熒光測量裝置來說最重要一點是避免激發光進入光譜儀，這可以通過不同方法實現（各種方法可以共同使用）：

1. 使用AvaLight-LED作為激發光源（窄帶寬），激發光波長不在熒光光譜范圍內。

2. 把（干涉）帶通濾光片或低通濾光片與AvaLight-DH-S氘-鹵鎢燈一起使用以得到高強度窄帶寬的激發光。

3. 確保激發光與熒光光路是90度垂直正交的，這樣激發光就不會進入接收光纖（使用CUV-UV/VIS-FL或CUV-DA）。

4. 利用熒光的遲豫時間把激發光和熒光分開。此時需要一個脈沖光源(脈沖激光器或AvaLight-XE脈沖氙燈)和一臺AvaSpec-2048FT快觸發型光譜儀（可通過軟件改變延遲時間）。