在治療原發病灶的同時，使用大劑量有效抗生素和全身支持療法來控制炎癥，促使膿腫吸收自愈。由于細菌性肝膿腫病人中毒癥狀嚴重，全身狀況差，故在應用大劑量抗生素控制感染的同時，應積極補液，糾正水與電解質紊亂，給予維生素B、C、K，必要時可反復多次輸入小劑量新鮮紅細胞、血漿和免疫球蛋白，以糾正低蛋白血癥，改善肝功能。主張有計劃地聯合應用抗生素，如先選用對需氧菌和厭氧菌均有效的藥物，待細菌培養和藥敏結果再選用敏感抗生素。多發性小膿腫經全身抗生素治療不能控制時，可考慮在肝動脈或門靜脈內置管滴注抗生素。
