薄層掃描儀是可以對斑點進行掃描的專用分光光度計,用可見光或紫外光作光源,線性掃描或鋸齒掃描薄層板展開后的斑點,該斑點就吸收該組分特征波長的單色光,剩余的單色光經透射或反射或發射熒光,由檢測器積分起來,獲得這塊斑點面積的待測物質含量。