1 、光學檢出法
a自然光(400~800nm)
b紫外光(254nm或365nm)
c熒光一些化合物吸收了較短波長的光，在瞬間發射出比照射光波長更長的光，而在紙或薄層上顯出不同顏色的熒光斑點(靈敏度高、專屬性高)
2 、蒸汽顯色法
多數有機化合物吸附碘蒸氣后顯示不同程度的黃褐色斑點，這種反應有可逆及不可逆兩種情況，前者在離開碘蒸氣后，黃褐色斑點逐漸消退，并且不會改變化合物的性質，且靈敏度也很高，故是定位時常用的方法；后者是由于化合物被碘蒸氣氧化、脫氫增強了共軛體系，因此在紫外光下可以發出強烈而穩定的熒光，對定性及定量都非常有利，但是制備薄層時要注意被分離的化合物是否改變了原來的性質。
3 、物理顯色法
用紫外照射分離后的紙或薄層后，使化合物產生光加成，光分解、光氧化還原及光異構等光化學反應，導致物質結構發生某些變化，如形成熒光發射功能團。發生熒光增強或淬滅及熒光物質的激發或發射波長發生移動等現象，從而提高了分析的靈敏度和選擇性。
4 、試劑顯色法
廣泛應用的定位方法。用于紙色譜的顯色劑一般都適用于薄層色譜，還有防腐劑的顯色劑不適合用于紙色譜及含有有機黏合劑薄層的顯色，又時噴顯色劑后續加熱，這也不是用于紙色譜。
顯色方法a噴霧顯色：顯色劑溶液以氣溶膠的形式均勻的噴灑在紙和薄層。b 浸漬顯色：揮去展開劑的薄層板，垂直的插入盛有展開劑的浸漬槽中，設定浸板及抽出速度和規定在顯色劑中浸漬的時間。