盡管大多數分泌蛋白是共翻譯易位的,但有些分泌蛋白在胞質溶膠中翻譯,然后通過翻譯后系統轉運到ER/質膜。在原核生物中,這一過程需要某些輔助因子,例如SecA和SecB,并由Sec62和Sec63(兩種膜結合蛋白)促進。嵌入ER膜中的Sec63復合物導致ATP水解,使伴侶蛋白與暴露的肽鏈結合,并將多肽滑入ER腔。一旦進入管腔,多肽鏈就可以正確折疊。該過程僅發生在位于胞質溶膠中的未折疊蛋白質中。
此外,針對其他細胞目的地的蛋白質,如線粒體、葉綠體或過氧化物酶體,使用專門的翻譯后途徑。靶向核的蛋白質也通過添加核定位信號(NLS)進行翻譯后易位,該信號促進通過核孔穿過核膜。