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  • 發布時間:2019-03-28 15:11 原文鏈接: 蛋白質氨基端及羧基端序列分析實驗5

    方案5 磷酸化多肽的固相微量測序實驗

    實驗材料

    放射性標記的多肽

    試劑、試劑盒

    碳二亞胺試劑偶聯緩沖液甲醇-水多肽溶劑S3 (氯丁烷 正丁醇)閃爍液

    儀器、耗材

    ATZ-收集器加熱塊小滴管Mylar 聚酯薄膜蛋白質測序儀閃爍計數器Sequelon-AA 試劑盒測試管

    實驗步驟

    1.將放射性標記的肽段在小試管中溶解于 20ul 適當的溶劑中(如含或不含 0.1%TFA 的 30% 乙腈水溶液,可能會將多肽從 RP-HPLC 柱上洗脫下來)。加熱混合物至 55°C,直至溶解。

    2.用契侖科夫法在閃爍計數器中計數(注音:契侖科夫計數時不加閃爍液)。

    3.將 Sequelon-AA 盤從試劑盒中取出,放置于 55°C 的聚醋薄膜上。

    4.滴加放射性標記的多肽到 Sequelon-AA 盤上,將盤完全干透。在閃爍計數器中對盤和樣品管進行計數。注意:仍然不加任何閃爍液。

    5.清洗管 3 次,每次用 10~20ul 多肽溶劑(與溶解多肽的溶液相同)。將清洗液滴加到 Sequelon-AA 盤上,每一次滴加后待晾干才能接著再滴加。如果樣品管仍有計數信號,繼續清洗。

    6.不加任何閃爍液,在閃爍計數器中檢測盤子。

    7.向測試管中滴加 100ul 偶聯緩沖液,加入 1mg 水溶性的碳二亞胺試劑 EDC。

    8.向空盤上滴加 5ul EDC 溶液,使反應在室溫下進行 20 min。

    9.樣品偶聯后,像步驟⑤那樣用多肽溶劑清洗幾次,將沒有進行共價結合的多肽洗去—因為它們在測序時會產生背景。在閃爍計數器中對盤子進行計數。

    10.用含 2 mmol/L 磷酸鈉的甲醇-水(9:1) 溶液代替 S3 試劑(氯丁烷)。

    11.將盤子放進蛋白質測序儀的反應容器中,使用含 2 mmol/L 磷酸鈉的甲醇-水 (9:1) 溶液。用 ATZ 收集程序進行標準的 Edman 測序。

    這樣將直接把最后的 ATZ 產物和 32P 標記的磷酸送入分段收集器。可以改進該程序,以便達到最佳的遞送試劑和溶劑的時間。含水的甲醇比氯丁烷具有更髙的黏性,所以傳送時間需要更長。更「精確」的儀器型號還會有確保遞送正確進行的傳感器,但不論怎樣,一定要確保完善的試劑遞送效果。

    12.在計數器中對溶于閃爍液的部分收集器中的樣品進行計數。

    在這里最好使用閃爍液。它大約可使放射性活性增大一倍,盡管背景也會相應地增高,但目前還沒有很好的方法提高信噪比。

    13.檢查 Edman 降解的效率,從測序儀反應器中取出盤子,晾干,再在閃爍計數器上檢查殘留的放射性水平。

    通常會剩下 10%~20% 的初始量,這主要取決于殘基數和測序儀的長度,可歸因于每一降解循環中正常的循環收率和累積的阻斷情況。

    展開 


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