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  • 發布時間:2020-05-25 11:46 原文鏈接: 蛋白質組學之逆襲:深度注釋基因組(三)

    人類尚未充分認識復雜的癌癥基因組是如何轉化為導致復發和死亡的驅動生物學的,將蛋白質組學與基因組學結合在一起能夠讓我們獲得對癌癥的新認識,同時提供一種有價值的資源以便科學界能夠用來提出關于這些疾病的新假設,以及治療它的手段。蛋白質基因組學終有一天會被證明是一種強大的臨床工具,使得人類能夠橫跨癌癥基因組學與臨床效應之間巨大的知識鴻溝。

    以上兩個案例中,蛋白質組學都使用了他獨門絕技串聯質譜技術中關鍵的一招——iTRAQ(這一招殺傷力極大,前面已作介紹,在此無需贅言),在此利用iTRAQ獲得強大的蛋白質組數據完成了對基因組更深層次的注釋。關于蛋白質基因組學夫婦的事跡就先介紹到這,但是他們的故事遠未結束,相信在他們的緊密合作之下,還會不斷碰撞出新的火花,比如說我們可以將基因組學中的測序或芯片數據與iTRAQ得到的蛋白質組學數據結合起來進行跨組學關聯分析(具體的分析方法并不難,可以私信黃博深入討論),從而獲得表達譜的全景圖,實現其間的互補和整合,對生物體特定狀態下的基因和蛋白質表達水平進行全方位分析;并且在全局上獲得對差異表達譜的廣泛理解,挖掘受轉錄后調控的關鍵蛋白/基因,尋找驗證某些重要的生物學調控;另外,對于一些蛋白數據庫尚不完善的物種,通過轉錄組數據構建蛋白質序列數據庫,提高蛋白質組學實驗中蛋白質的鑒定數目。


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