蛋白芯片技術的研究對象是蛋白質，其原理是對固相載體進行特殊的化學處理，再將已知的蛋白分子產物固定其上（如酶、抗原、抗體、受體、配體、細胞因子等），根據這些生物分子的特性，捕獲能與之特異性結合的待測蛋白（存在于血清、血漿、淋巴、間質液、尿液、滲出液、細胞溶解液、分泌液等），經洗滌、純化，再進行確認和生化分析；
它為獲得重要生命信息（如未知蛋白組分、序列。體內表達水平生物學功能、與其他分子的相互調控關系、藥物篩選、藥物靶位的選擇等）提供有力的技術支持。
