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  • 發布時間:2019-03-29 18:32 原文鏈接: 蛋白質的SDSPAGE電泳

    按所用小型平板凝膠裝置調整溶液體積,膠板大小約在 8X10X0.15 cm。在此大小范圍內有幾種形式可以利用。制膠的裝置有玻璃板、塑料隔條(通常厚度為 0.1~0.2 cm) 和鑄膠時成孔用的 Teflon 梳子。下面逐步示教 SDS-PAGE 的操作程序。本實驗來源于蛋白質純化與鑒定實驗指南,作者:朱厚礎

    試劑、試劑盒

    過硫酸銨含 2-巰基乙醇的樣品緩沖液樣品緩沖液 (2X) 儲液電泳緩沖液電極緩沖液壓縮膠緩沖液分離膠緩沖液

    實驗步驟

    鑄分離膠(下層膠)

    裝置的清洗
    為使角蛋白的污染減至最少,將玻板、梳子和隔條浸泡在含強堿性去垢劑〔2%RBS 35 液(Pierce Chemical Co.)〕提濃物的水溶液(每 1000 ml 水加 20 ml 提濃物中。可將去垢劑溶液置于一帶蓋的盆中,盆中放一支架,將玻板懸置于支架上至少保持 10 min(或過夜)。此外,努力保持凝膠材料和溶液盡可能是無塵的。有時要用緩沖液對吸管進行預沖洗,以除去可能沉積于吸管內的灰塵顆粒。操作時要一直戴手套并經常變動它們的位置。用不會留下顆粒的紙巾(如 Kimwipes 紙巾)擦干玻板,或用甲醇或丙酮洗滌玻板并在通風櫥中風干。

    分離膠的混合
    在對待測蛋白質的大小所作最佳估計的基礎上,選擇合適的丙烯酰胺濃度。下表概括了制備不同百分比的丙烯酰胺/雙丙烯酰胺混合物所需成分的用量。表的上方給出了最小待測蛋白質的分子量范圍。



    分離膠的灌注
    1) 將丙烯酰胺/雙丙烯酰胺、H20、4x 分離膠緩沖液混合于帶側臂口的小號 (25 ml)愛倫美氏燒瓶。

    2) 用塞塞住瓶口,混合物真空脫氣 10 min。

    3) 加 APS, 溫和但徹底混勻。盡量避免產生氣泡。

    4) 加 TEMED。溫和但迅速混勻。

    5) 用經水預洗凈的巴氏吸管灌注膠液,直至液面高度離玻板頂部約 1 cm 處。

    6) 用預洗凈的巴氏吸管在膠液上面均勻布一層異丁醇(2-甲基-1-丙醇)。異丁醇層應高約 2 mm。

    7) 分離膠至少聚合 1 h。

    鑄壓縮膠(上層膠)

    壓縮膠的混合



    壓縮膠的灌注

    1) 將丙烯酰胺/雙丙烯酰胺、H2O、4x 分離膠緩沖液混合于帶側臂口的小號(25 ml) 愛倫美氏燒瓶。

    2) 用塞塞住瓶口,混合物真空下脫氣 10 min。

    3) 分離膠聚合后,傾出上層液體異丁醇和未聚合的丙烯酰胺。

    4)用蒸餾、去離子水洗滌膠的上部。

    5) 用壓縮膠液洗滌膠的上部。

    6) 將梳子插入玻板之間。

    7) 加 APS, 溫和但徹底混勻。努力避免產生氣泡。

    8) 加 TEMED。溫和但迅速混勻。

    9) 用預先經水洗凈的巴氏吸管灌注壓縮膠液。

    壓縮膠應在 10 mm 內聚合。在 2 h 內使用。

    電泳

    樣品的制備
    1) 將沉淀或凍干的各樣品分別置于 1.5-ml 具蓋聚丙烯離心管中,各加入 5~20ul 含 2-巰基乙醇的 1X 樣品緩沖液(配方見 p.257)。短暫震蕩混合后立即置于沸水浴中支架上 5 min。

    2)樣品冷卻至室溫,微型離心機短暫離心(~10s)。

    加樣
    1)小心地取出梳子,將聚合的凝膠安置于電泳槽中。上、下槽中加入電泳緩沖液 (1X)(配方見 PP.256~257),確保每個樣品孔中都充滿緩沖液。小心地去除樣品孔中的所有氣泡或額外的聚丙烯酰胺碎片。

    2) 每個樣品按合適的體積加樣,對于 0.15 cm 厚的膠,通常最多加 15ul 樣品因樣品含 10% 甘油,樣品會通過樣品孔中的緩沖液而沉入孔底。

    3) 當心樣品不要溢出至樣品孔間的分隔部而混合。用自動移液器上樣應用出口極細的吸頭,每個樣品換一個吸頭。

    電泳
    1) 將電極導線接至電源,黑的接于負極,紅的接于正極 pH8.3 時,與 SDS 結合的蛋白質荷負電,它們將向正極遷移。

    2) 壓縮膠部分每塊膠以 8mA 電流(恒流) 電泳。若兩塊膠在一個電泳槽內同時進行電泳,則以 16mA 電流進行電泳。在壓縮膠/分離膠界面處,蛋白質樣品將壓縮成一窄帶。

    3) 當溴酚藍進入分離膠時,每塊膠的電流增至 18mA。

    4) 溴酚藍達到膠的底部時,即關掉電源,停止電泳。不應讓溴酚藍跑出底部。

    溶液和緩沖液的配制

    丙烯酰胺/雙丙烯酰胺儲液(30:0.8)(1000 ml)

    30%(w/v) 丙烯酰胺 300 g

    0.8%(w/v) 雙丙烯酰胺 8 g

    加去離子蒸餾水,至終體積 1000 ml。經 0.22-um 膜過濾。存于 4°C 暗處。

    分離膠緩沖液(4x)

    1.5mol/LTris-HCl(pH8.0)

    0.4%(w/v)SDS



    加去離子蒸餾水, 至所需終體積。室溫下用 HCl 調 pH 至 8.8。經 0.22-um 膜過濾。存于 4°C

    壓縮膠緩沖液 (4X)

    0.5mol/LTris-HCl(pH6.8)

    0.4%(w/v)SDS



    加去離子蒸餾水, 至所需終體積。室溫下用 HC1 調 pH 至 6.8。經 0.22-um 膜過濾。存于 4°C。

    電極緩沖液 (4X)

    0.1mol/LTris

    0.768mol/L 甘氨酸



    加去離子蒸餾水,至所需終體積。不必調 pH。此比例時 Tris 堿-甘氨酸的 pH 應為 8.3。室溫下存于大容器(酸壇)中。

    SDS(10%;w/v)

    (100 ml)

    取 10 gSDS 溶于去離子蒸餾水中,至終體積 100 ml。室溫下存于潔凈瓶中。

    電泳緩沖液(1X)

    1/4 體積的 4x 電極緩沖液與 3/4 體積的去離子蒸餾水混合。然后加 1/100 體積的 10%SDS 至終濃度 0.1%(w/v)SDS。實例如下:



    樣品緩沖液 (2X) 儲液

    0.25mol/LTris-HCl(pH6.8)

    4%(w/v)SDS

    20%(v/v) 甘油

    痕量溴酚藍

    配制此緩沖液時,應極小心,戴手套,并避免角蛋白(皮膚上即存在此蛋白) 對緩沖液的污染。



    加 H2O 至 100 ml 終體積。此緩沖液可室溫下保存或等分凍干保存,但用前必須溫熱以確保 SDS 于溶液中。應保證反復使用此溶液的同一儲液而不被污染。等分保存將有助于避免這個問題。

    含 2-巰基乙醇的樣品緩沖液(1X)

    用前配制樣品緩沖液的工作液,稀釋 2X 樣品緩沖液儲液(見上,加入 2-巰基乙醇至終濃度為 5%(v/v)。例如:

    2x 樣品緩沖液儲液                                100ul

    H20                                                        90ul

    2-巰基乙醇                                            10ul/200ul

    過硫酸銨 (APS)(10%;W/V)

    取 3 g 過硫酸銨,溶于去離子蒸餾水,至終體積為 30 ml。此溶液 4°C 下在短暫的數日內是穩定的,但建議,對每一組新膠均應新鮮配制。


    展開


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