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  • 發布時間:2019-03-25 16:00 原文鏈接: 血基因組DNA提取實驗——血基因組DNA試劑盒提取法

    血基因組DNA提取可用于:(1)從凍全血、血漿、血清、骨髓、其他體液、淋巴細胞、培養細胞、病毒和線粒體中提取DNA;(2)用于后續測序、遺傳信息學等研究。

    實驗方法原理采用特殊的細胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)從抗凝全血中得到基因組DNA。
    實驗材料

    抗凝全血

    試劑、試劑盒

    血基因組DNA 試劑盒

    儀器、耗材

    96孔深孔板96圓孔板96孔DNA制備板96圓孔硅膠片BF-400膜

    實驗步驟

    一、試劑盒組成、貯存、穩定性
     

    1.  說明書,耗材:96孔深孔板(1.6 ml),96圓孔板,96孔DNA制備板,96圓孔硅膠片,BF-400膜。
     

    2.  Proteinase K:凍干的蛋白酶K 可室溫貯存6 個月,長時間保存請置于4℃;溶解后,在2-8℃可貯存2 個月,長時間保存請勿置于室溫中。
     

    3.  Buffer PK :蛋白酶K 溶解液,室溫密閉貯存。
     

    4.  Buffer BL :細胞裂解液,室溫密閉貯存。
     

    5.  Buffer W1B concentrate :洗滌液。使用前,根據瓶上數量加入乙醇,混合均勻,室溫密閉貯存。可用100%乙醇或95%乙醇。
     

    6.  Buffer W2 concentrate :去鹽液。使用前,根據瓶上數量加入乙醇,混合均勻,室溫密閉貯存。可用100%乙醇或95%乙醇。
     

    7.  10xBuffer W2(12x96 試劑盒):用于配制Buffer W2 。
     

    8.  Eluent B:7.5 mM Tris-HCl,pH 8.5,0.3 mM EDTA ,室溫密閉貯存。
     

    二、實驗準備
     

    1.  第一次使用時,在Buffer W2 concentrate 和Buffer W1B concentrate 中按試劑瓶上指定的體積加入無水乙醇。
     

    2.  Buffer W2(12x96 試劑盒)配制:在提供的500 ml 空瓶中加入15 ml 10xBuffer W2,135 ml 去離子水和350 ml 乙醇,可用100%無水乙醇或95%乙醇。
     

    3. 根據瓶上標簽將蛋白酶K 溶解于Buffer PK 中,請勿旋渦振蕩。
     

    4. 準備70℃溫浴。
     

    5. 使用前檢查Buffer BL 是否有沉淀析出,若出現沉淀,請于70℃溫浴加熱至沉淀完全溶解后再使用。
     

    三、操作步驟
     

    1.  向96 圓孔板的每孔中加入20 ul 蛋白酶K。
     

    2.  加200 ul 抗凝全血到96 圓孔板中。
     

    * 若全血樣品體積少于200 ul,用PBS 補充到200 ul。

    * 若樣品為鳥類血,樣品用量須低于10 ul。

    * 若需得到RNA-free 的基因組DNA,在步驟3 加入Buffer BL 前加入DNase-free 的RNase A(20 mg/ ml) 。
     

    3.  加200 ul Buffer BL ,注意不要打濕每孔的邊緣,用96 圓孔硅膠片密封各孔。
     

    4.  用力混合30 s。
     

    5. 3000 rpm 簡短離心使96 圓孔硅膠片上的溶液到96圓孔板內。啟動離心機,當速度達到3000rpm后即停止。
     

    6. 在培養箱或烘箱中70℃溫浴至少10 min。
     

    7.  3 000 rpm 簡短離心使96 圓孔硅膠片上的溶液到96圓孔板內。啟動離心機,當速度達到3 000rpm后即停止。
     

    8. 取下96 圓孔硅膠片,每孔加入200 ul 乙醇(96-100%)。
     

    9.  用96 圓孔硅膠片密封各孔,用力混勻混合15 s。3 000 rpm 簡短離心使96 圓孔硅膠片上的溶液到圓孔板內。啟動離心機,當速度達到3 000 rpm 后即停止。
     

    10.  將96 孔DNA 板放到一潔凈的96 孔1.6 ml 深孔板。取下圓孔板上的96 圓孔硅膠片,將每孔中的溶液轉移至96 孔DNA 板 中,6 000 rpm 離心4 min。
     

    11.  丟棄96 孔1.6 ml 深孔板的濾液,將96 孔DNA 板放回到96 孔1.6 ml 深孔板上,每孔加入500 ul Buffer W1B,用一新的BF-400 膜密封96 孔DNA 板,6 000 rpm 離心4 min。
     

    * 確認在Buffer W1B concentrate 中已按試劑瓶上的指定體積加入無水乙醇。
     

    12.  丟棄96 孔1.6 ml 深孔板的濾液,將96 孔DNA 板放回到96 孔1.6 ml 深孔板上,每孔加入850 ul Buffer W2,用另一新 的BF-400膜密封96孔DNA板,6 000 rpm 離心4 min。
     

    * 確認在Buffer W2 concentrate 中已按試劑瓶上的指定體積加入無水乙醇。
     

    13.  棄濾液,將96孔DNA板放回到96孔1.6 ml 深孔板上,每孔加入400 ul Buffer W2, 用另一新的BF-400 膜密封96 孔DNA 板,6 000 rpm 離心4 min。
     

    14.  將96孔DNA板放在一潔凈的96 孔1.6 ml 深孔板上,用BF-400膜密封96孔DNA板,6 000 rpm離心15 min。
     

    15.  將96孔DNA板放在另一潔凈的96 孔1.6 ml 深孔板上,每孔加入100-200 ul Eluent B 或去離子水,室溫靜置2 min,用另一新的BF-400膜密封96 孔DNA板,6 000 rpm 離心4min洗脫得到DNA。
     

    收起 
    注意事項

     1.  Buffer BL 和Buffer W1B 含刺激性化合物,操作時要戴乳膠手套和眼鏡,避免沾染皮膚、眼睛和衣服,謹防吸入口鼻。若沾染皮膚、眼睛時,要立即用大量清水和生理鹽水沖洗,必要時尋求醫療咨詢。


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