1.細菌感染
致病菌主要是葡萄球菌,可有多種原發病灶,如皮膚軟組織感染、肺炎、細菌性心內膜炎、骨髓炎,可以引起菌血癥或膿毒癥,經肝動脈系統侵及肝臟導致肝膿腫。
2.原蟲
主要的病原體是阿米巴滋養體,阿米巴腸炎破潰處的阿米巴滋養體可經過肝臟門靜脈系統進入,導致阿米巴肝膿腫。