1.經典途徑：
經典途徑是以結合抗原后的IgG或IgM類抗體為主要激活劑，補體C1～C9共11種成分全部參與的激活途徑。除了抗原抗體復合物外，還有許多因子可激活此途徑，如非特異性凝集的Ig、細菌脂多糖、一些RNA腫瘤病毒、雙鏈DNA.胰蛋白酶、纖溶酶、尿酸鹽結晶、C-反應蛋白等。經典活化途徑可人為地分成識別、活化和膜攻擊3個階段。
2.替代途徑：
替代途徑又稱旁路途徑。它與經典途徑的不同之處主要是越過C1、C4和C2，直接激活補體C3，然后完成C5～C9的激活過程；參與此途徑的血清成分尚有B.D.P、H、I等因子。替代途徑的激活物主要是細胞壁成分，如內毒素、某些蛋白水解酶、IgG4、IgA聚合物等。替代途徑是通過研究C4缺陷而仍保持補體系統活化的患者而發現的。