植物體中有幾種PQ，它們的區別是異戊二烯單位數目不同。葉綠體中最多的是PQ9。在光合鏈中，既可傳遞電子，又可傳遞質子，其氧化還原反應：氧化還原電位約為0.1伏。
氧化型的PQ從類囊體膜的靠外一側接受電子，并與膜外質子結合，爾后向內擴散，在膜內側被細胞色素f氧化，交出電子，同時把質子釋放到膜內腔。
即伴隨PQ氧化和還原作用，使質子從膜外橫渡膜進入膜內腔。這種質子的移動與光合磷酸化有關。
