2)加200μl新配制的溶液Ⅱ。
溶液Ⅱ
0.2mol/L NaOH(臨用前用10mol/L貯存液現用現稀釋)
1%SDS
蓋緊管口,快速顛倒離心管5次,以混合內容物。應確保離心管的整個內表面
均與溶液Ⅱ接觸。不要振蕩,將離心管放置于冰上。
3)加150μl用冰預冷的溶液Ⅲ
溶液Ⅲ
5mol/L乙酸鉀 60ml
冰乙酸 11.5ml
水 28.5ml
所配成的溶液對鉀是3mol/L,對乙酸根是5mol/L。
蓋緊管口,將管倒置后和地振蕩10秒鐘溶液Ⅲ在粘稠的細菌裂解物中分散均勻,之后
將管置于冰上3-5分鐘。
4)用微量離心機于4℃12 000g離心5分種,將上清轉移到另一離心管中。
5)可做可不做:加等量酚:氯念,振蕩混勻,用微量離心機于4 ℃以12000g離心2分鐘,將上清轉移到另一良心管中。有些工作者認為不必用酚:氯仿進行抽提,然而由于一些未知的原因,省略這一步,往往會得到可耐受限制酶切反應的DNA。
6)用2倍休積的乙醇于室溫沉淀雙錠DNA。振蕩混合,于室溫放置2分鐘。
7)用微量離心機于4℃以12 000g離心5分鐘。
8)小心吸去上清液,將離心管倒置于一張紙巾上,以使所有液體流出。再將附于管壁的液滴除盡。除去上清的簡便方法是用一次性使用的吸頭與真空管道相連,并用吸頭接觸液面。當液體從管中吸出時,盡量使吸頭遠離核酸沉淀,然后繼續用吸頭通過抽真空除去附于管壁的液滴。
9)用1ml70%乙醇于4℃洗滌雙鏈DNA沉淀,按步驟8)所術方法去掉上清,在空氣中使核酸沉淀干燥10分鐘。
i.此法制備的高拷貝數質粒(如Xf3或pUC),其產量一般約為:每毫升原細菌培養物3-5μg。
ii.如果要通過限制酶切割反應來分析DNA,可取1μl DNA溶液加到另一含8μl水的微量離心管內,加1μl 10×限制酶緩沖液和1單位所需限制酶,在適宜溫育1-2小時。將剩余的DNA貯存于-20℃。
iii.此方法按適當比例放大可適用于100ml細菌培養物:
3.煮沸裂解
1)將細菌沉淀,所得重懸于350μlSTET中。
STET
0.1mol/L NaCL
10mmol/L Tris.Cl(pH8.0)
1mmol/L EDTA(pH8.0)
5% Triton X-100
2)加25μl新配制的溶菌酶溶液[10mg/ml,用10mmol/L Tris.Cl(pH8.0)配制],振蕩3秒鐘以混勻之。如果溶淮中pH低于8.0,溶菌酶就不能有效發揮作用。
3)將離心管放入煮沸的水浴中,時間恰為40秒。
4)用微量離心機于室溫以12 000g離心10分種。
5)用無菌牙簽從微量離心管中去除細菌碎片。
6)在上清中加入40μl 5mol/L乙酸鈉(pH5.2)和420μl異丙醇,振蕩混勻,于室溫放置5分鐘。
7)用微量離心機于4℃以12 000g離心5分種,回收核酸沉淀。
8)小心吸去上清液,將離心管倒置于一張紙巾上,以使所有液體流出。再將附于管壁的液滴除盡。除去上清的簡便方法是用一次性使用的吸頭與真空管道相連,輕緩抽吸,并用吸頭接觸液面。當液體從管中吸出時,盡可能使吸頭遠離核酸沉淀,然后繼續用吸頭通過抽真空除去附于管的液滴。
9)加1ml 70%乙醇,于4℃以12 000g離心2分鐘。
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