質譜中一級質譜，二級質譜的區別和作用，如下：
區別：
1、顯示目標不同。
一級質譜主要是給出目標物的分子量，GC-MS一級譜圖可以定性分析，LCMS只能用于簡單的分子量測定。一級質譜有的時候受儀器的分辨率影響，給出的質荷比不能準確定性，比如相同分子量的不同分子，在儀器分辨率不夠足夠高的時候很難區分。
二級質譜可以看出目標物的部分碎片，可以對目標物的結構進行分析。一定程度上可以降低噪音，提高信噪比，從而提高靈敏度，從而也可以節省前處理步驟，可以更好地提高結果準確度，避免假陽性或者假陰性的結果。LCMS/MS完全可以用于定性分析。
2、等級不同。
一級質譜為一級，二級質譜為二級。
作用：一級質譜檢測所有帶電離子的質荷比和強度，形成一級譜圖。一級質譜中的信號為母離子肽段信號。二級質譜按照一定方式選擇母離子肽段，將其進一步解離，分析所形成的子離子的質荷比和強度。