一、準備工作
1、實驗器具與材料:
(1)移液槍:200ul、10ul
(2)吸頭:200ul、20ul
(3)EP管1。5ml、100ul
(4)水浴箱
2、實驗器具的處理與準備
塑料制品:(包括吸頭、EP管等)
將塑料制品逐個浸泡于1‰DEPC水中(必要時小槍頭需要用吸管打入DEPC水)37℃過夜,然后送至高壓3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小時左右烘干),試驗前將槍頭放入吸頭臺。
3、試劑配制和準備:
(1)DEPC水:泡實驗器具的DEPC水的配制:1000ml雙蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中靜置4小時后備用。逆轉錄中所用的DEPC水的配制:100ml鹽水瓶內裝40ml雙蒸水,加40ulDEPC,37℃過夜,送至高壓,后分裝到幾個1。5mlEP管中,-20℃中保存備用。
(2)RT中所需要的各種試劑
(3)引物濃度計算方法:(新合成的引物的稀釋)假如終濃度為XuM(pmol/ul)加DEPC水體積(ul)=(OD×33×1000000)/(分子量×X)
二、RT時注意事項:
三、RT步驟
(一)用SSⅢ逆轉錄酶進行RT(20ul體積)
1、準備0、65ml的EP管
2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暫離心。
3、65℃水浴5分鐘后,立刻0℃冰水浴至少1分鐘。
4、短暫離心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAse Inhibitor,1ulSSⅢ逆轉錄酶。
5、短暫離心
6、50℃水浴60分鐘進行逆轉錄。
7、70℃水浴15分鐘滅活逆轉錄酶
8、-20℃保存,或立即進行PCR。
(二)用AMV逆轉錄酶進行RT(10ul體積)
1、準備0.65mlEP管
2、加入4.5ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA
3、稍離心,100℃沸水裕1min
4、加入0.5uldNTP,2ul5×Buffer,1ulAMV逆轉錄酶
5、稍離心,封口膜封口,42℃水浴90℃作RT
6、100℃沸水裕3min滅活AMV
7、立即PCR或-20℃保存。