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  • 發布時間:2019-03-25 21:25 原文鏈接: 通過CsCl等密度梯度離心純化λ噬菌體顆粒實驗

    CsCl 等密度梯度離心用于制備最高純度的感染性 λ 噬菌體顆粒,它沒有任何細菌核酸的污染。從這種噬菌體顆粒中提取的 DNA 可用作 DNA 測序的模板、亞克隆至質粒載體和產生用于原位雜交的探針。這種方法第二個優點是,由它所獲得的噬菌體原種是高度濃縮的(大于 1011 cfu/ml),在 4℃ 保存時,許多年后仍能保持它們的感染力。本實驗來源「分子克隆實驗指南


    實驗方法原理CsCl 等密度梯度離心用于制備最高純度的感染性 λ 噬菌體顆粒,它沒有任何細菌核酸的污染。從這種噬菌體顆粒中提取的 DNA 可用作 DNA 測序的模板、亞克隆至質粒載體和產生用于原位雜交的探針。這種方法第二個優點是,由它所獲得的噬菌體原種是高度濃縮的(大于 1011 cfu/ml),在 4℃ 保存時,許多年后仍能保持它們的感染力。
    實驗材料

    λ 噬菌體懸浮液

    試劑、試劑盒

    CsCl乙醇

    儀器、耗材

    Beckman SW41 或 SW28 轉子或相當型號Beckman Ti50 或 SW50.1 轉子或相當型號皮下注射用針頭

    實驗步驟

    一、材料

    1. 緩沖液和溶液

    (1) CsCl(固體)

    (2) CsCl 溶液



    (3) 乙醇

    2. 離心機和轉子

    (1) Beckman SW41 或 SW28 轉子或相當型號

    (2) Beckman Ti50 或 SW50.1 轉子或相當型號,配有清亮的離心管(如 Beckman 超亮離心管)

    3. 專用設備

    皮下注射用針頭(21號)

    4. 載體和菌株

    λ 噬菌體懸浮液

    二、方法

    1. 測定噬菌體懸浮液的體積,每毫升加入 0.5 g 固體 CsCl,攪拌混勻使其完全溶解。

    2. 倒入足夠量的 CsCl 分級梯度,使噬菌體懸浮液分成幾個組分,每個梯度能容納約 16 ml 噬菌體懸浮液。所需分級梯度的量等于親水相的最終體積(步驟1),親水相又被分成數份,每份為 0.4 X 離心管體積。用適合于 Beckman SW41 或 SW28 轉子(或相當型號)的清亮塑料離心管(如 Beckman 超亮離心管)。



    3. 在 ρ=1.50 g/ml 和 ρ=1.45 g/ml 兩層界面的相應試管壁外側,用永久性標簽筆作上標記。



    CsCl 分級梯度大約占超離管體積的 60%。比如,對一個能裝 38 ml 的 Beckman SW28 試管(或相當型號),分級梯度由三種均為 7.6 ml 的 CsCl 溶液組成。平衡管裝有同樣密度的 CsCl 溶液。

    4. 小心地將噬菌體懸浮液加至分級梯度上,4℃,87000 g ( 22000 r/min 于 Beckman SW28 轉子中)離心 2 h。

    5. 按下面的方法對離心管進行穿孔,以收集噬菌體顆粒。

    (1) 用酒精仔細地擦去離心管外的油污,然后在離心管的外側貼上 Scotch 膠帶,與噬菌體顆粒帶平齊。

    膠帶起到封條的作用,防止針頭四周滲漏。

    (2) 用 21 號皮下注射用針頭(不需要注射針筒)穿過膠帶刺入離心管,收集噬菌體顆粒帶。



    手指遠離針頭刺入方向,以免剌穿離心管。注意不要使梯度中其他帶內物質污染噬菌體顆粒。這些帶內含有細胞碎片和未裝配的噬菌體成分。

    6. 將噬菌體顆粒懸浮液裝入適宜于 Beckman Ti50 或 SW50.1 轉子(或相當型號)的超離管中,加入 CsCl 溶液(ρ=1.5 g/ml 于 SM 中)。4℃,150000 g ( 41000 r/min 于 Beckman Ti50 轉子中)離心 24 h 或 160000 g ( 36000 r/min 于 Beckman SW50.1 轉 子中)離心 24 h。



    7. 如步驟 5 所述收集噬菌體顆粒帶,于 CsCl 溶液中 4℃ 密封保存于一試管中。

    8. ( 可供選擇)如果必要,噬菌體顆粒可通過新一輪的 CsCl 平衡梯度離心進一步純化和濃縮。將噬菌體懸浮液轉移至適宜于 Beckman SW50.1 轉子(或相當型號)的一個或多個超離管中,加入 CsCl 溶液(ρ=1.5 g/ml 于 SM 中),160000 g ( 36000 r/min 于 Becrkman SW50.1 轉子中)4℃ 離心 24 h。當離心完成后,如下面“替代方案”的步驟 3 和 4 所述收集噬菌體顆粒。



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