一方向性：密碼子及組成密碼子的各堿基在mRNA序列中的排列具有方向性（direction），翻譯時的閱讀方向只能是5ˊ→3ˊ；
二連續性：mRNA序列上的各個密碼子及密碼子的各堿基是連續排列的，密碼子及密碼子的各個堿基之間沒有間隔，每個堿基只讀一次，不重疊閱讀；
三簡并性：一種氨基酸可具有兩個或兩個以上的密碼子為其編碼。遺傳密碼表中顯示，每個氨基酸都有2,3,4或6個密碼子為其編碼（除甲硫氨酸只有一個外），但每種密碼子只對應一個氨基酸，或對應終止信息；
四通用性：生物界的所有生物，幾乎都通用這一套密碼子表；
五擺動性：tRNA（信使RNA）的最后一位，和mRNA的對應不完全，導致了簡并性。