試劑、試劑盒 液氮 研磨緩沖液TLE 緩沖液平衡酚)氯仿IiCl 溶液 (DEPC 處理)乙酸鈉 (DEPC 處理) 無水乙醇DEPC 處理水
儀器、耗材 Folytron 勻漿器(BrinkmarmPT10 35)
實驗步驟
一 材料與設備
1) 液氮
2) 研磨緩沖液 18mol/LTris,0.09mol/LLiCl,4.5 mmol/LEDTA,1%SDS,用 HC1 調 pH 至 8.2。此緩沖液與加了 1/10 體積 10%SDS 的 TLE 緩沖液相當
3)TLE 緩沖液平衡酚(TLE 緩沖液:0,2mol/LTris,0.lmol/LLiCl,5 mmol/LEDTA,用 HC1 調 pH 至 8.2)
4) 氯仿
5)8mol/L 和 2mol/LIiCl 溶液 (DEPC 處理)
6)3mol/L 乙酸鈉 (DEPC 處理)
7) 無水乙醇
S)DEPC 處理水
9)Folytron 勻漿器(BrinkmarmPT10/35)
二 操作方法
1) 研缽和研杵先用液氮冷卻,稱出 15 g 凍結植物組織放置于研缽中 (加液氮保持凍結),用研杵磨成粉末,立即轉移到一個盛有 150 mL 研磨緩沖液和 50 ml TLE 緩沖液平衡酚的 500 ml 燒杯中
2)Polytron 勻漿器,設定在 5?6 檔勻漿 2 min. 加人 50 ml 氯仿,并用勻漿器在低速下混句。將混合物移至 500 ml 離心瓶中,于 50℃ 加熱 20 min
3) 于 4℃ 在 17700 g 下離心 20 min。將上層水相移至另一個干凈離心瓶中界面保待后繼步驟 4 處理),加入 50 mlTLE 緩沖液平衡酚,混勻,再加 50m 氯仿。
4) 將上步殘余的水相連同界面 h 的物質移入一個 50 ml 離心管中,于 4℃12100 g 離心 20 min。
5) 吸出水相,與步驟 3 的水相及酚、氯仿混合物合并,劇烈混合。
6) 于 4℃17700 g 離心 15 min, 水相移入另一干凈 500 ml 離心瓶。
7) 用 TLE 平衡酚反復抽提水相. 直至兩相間界面干凈為止,水相再以氯仿抽提。
8) 將水相移入 250 ml 離心瓶中,加入 LiCl 至終濃度為 2mol/L(加約 0.33 體積的 8mol/LLiCl) 在 4℃ 沉淀并過夜。
9) 于 4℃15300 g 離心 20 min,沉淀以 2?3 ml2mol/LLiCI 溶液洗滌
10) 沉淀以 5 ml 水重溶,并移人 15 ml 離心管中,加人 LiCl 溶液至 2mol/L., 于 4°C 沉淀 RNA2 h 以上。
11) 于 4℃15300(?離心 20 min, 用 2mol/LLiCl 溶液洗滌一次,重溶于 2 ml 水,加入200ul 3mol/L 乙酸鈉溶液和 5.5 ml 無水乙醇,一 20℃ 沉淀過夜或在干冰/乙醇中沉淀 30 min
12) 于 4℃17700 g 離心 15 min 用 1 ml 水重溶沉淀。取 10ul 稀釋至 lml 測 OD260 和 OD280。
注意事項
適于制備 RNA 的原材料 (如豌豆種子)15 g 即可獲得 7 mg 總 RNA, 但 15 g 成熟的擬南芥原料可得總 RNA