實驗方法原理 用這一方法制備的 DNA 適用于瓊脂糖凝膠電泳、Southern 印跡、亞克隆、基因組文庫構建、PCR 或其他不需要完整的高分子質量 DNA 的方法。
實驗材料 YAC 克隆的酵母菌落
試劑、試劑盒 醋酸銨乙醇酚氯仿TETriton SDS 溶液
儀器、耗材 YPD 培養基Sorvall SS-34 轉頭或同類產品玻璃珠
實驗步驟
一、材料
1. 緩沖液和溶液
醋酸銨(10 mol/L )
乙醇
酚:氯仿(1:1,V/V)
TE ( pH 8.0)
含 20 μg/ml RNase 的 TE ( pH 8.0)
Triton/SDS 溶液
2. 培養基
YPD 培養基
3. 離心機和轉頭
Sorvall SS-34 轉頭或同類產品
4. 專用設備
玻璃珠
5. 載體和酵母菌株
攜帶目的 YAC 克隆的酵母菌落
二、方法
細胞培養
1. 將一個含目的 YAC 克隆的酵母菌落接種到 10 ml YPD 培養基中,30℃ 振搖過夜。
2. 2000 g ( Sorvall SS-34 轉頭,4100 r/min) 離心 5 min 收集細胞。
3. 棄去培養基,加 1 ml 無菌水,輕輕振動,使細胞懸浮于溶液中。
4. 按步驟 2 的方法收集細胞。
5. 去除上清,將細胞重懸于 0.5 ml 無菌水,然后移入一 1.5 ml 無菌離心管中。
6. 室溫下在微量離心機中以最大轉速離心 5 s,去除上清,收集細胞。
DNA 的提取
7. 加入 0.2 ml Triton/SDS 溶液于細胞中,輕叩離心管側壁,使細胞沉淀重新懸浮。
8. 加入 0.2 ml 酚: 氯仿和 0.3 g 玻璃珠。室溫振蕩 2 min。加 0.2 ml TE ( pH 8.0),稍加振蕩,使體系混勻。
9. 室溫下,在微量離心機中以最大轉速離心 5 min,使有機相和水相分開。將上層水相移入另一新的離心管中。小心操作,避免將兩相界面處的物質吸入。
DNA 的分離
10. 加入 1 ml 乙醇到水相中,蓋上管蓋,將小管輕輕翻轉數次,混勻。
11. 在微量離心機中以最大轉速 4℃ 離心 2~5 min, 使 DNA 形成沉淀。用巴斯德吸管吸去上清。再次進行短暫的離心(2 s ), 除去離心管底部最后殘余的乙醇。
12. 用 0.4 ml 含 RNase 的 TE ( pH 8.0 ) 溶解核酸沉淀,然后在 37℃ 溫育 5 min。
13. 加入等體積酚: 氯仿溶液抽提經 RNA 酶消化后的溶液。最好用翻轉離心管的方法混勻,不要用渦旋振蕩。室溫下,在微量離心機中以最大轉速離心 5 min, 使水相和有機相分層。將水相移入另一新離心管中。
14. 在水相中加入 80 μl 10 mol/L 醋酸銨和 1 ml 乙醇。輕輕地翻轉小管進行混勻。室溫放置 5 min。
15. 微量離心機離心 5 min 收集 DNA 沉淀。棄上淸,用 0.5 ml 70% 乙醇灌洗核酸沉淀。 以最大轉速離心 2 min, 用巴斯德吸管吸去乙醇漂洗液。再次進行短暫的離心(2 s), 吸去離心管底部最后殘余的乙醇。將 DNA 沉淀在空氣中干燥 5 min,然后用 50 μl TE (pH 8.0) 溶解。