一是DNA重組疫苗，以這一方式面世的第一種疫苗是乙型肝炎疫苗。該疫苗對乙型肝炎表面抗原HBsAg進行克隆擴增，應用重組DNA技術從酵母菌生產疫苗。
二是通過消除和修飾病原微生物上已知的導致致病性基因來制備疫苗。以此方法研制的針對輪狀病毒的第一代重組疫苗已在美國和芬蘭進行臨床試驗，研究結果提示該疫苗對由輪狀病毒所致的兒童腹瀉具有很強的保護性。
三是通過在一個非致病性微生物如病毒體內插入病原微生物的某個基因，然后被修飾的病毒作為一個攜帶者或載體來表達該外來基因，從而誘導免疫反應。這一技術正被應用于HIV疫苗的研制。
疫苗是一種抗原，注入血液后刺激免疫系統合成抗體