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  • 發布時間:2021-01-30 20:46 原文鏈接: 銀杏生物新項目致力于識別合成生物威脅

      全球領先的基因合成公司都會定期對客戶的DNA序列進行篩選,以識別用于合成有害病毒、細菌、毒素和其他潛在威脅的訂單。這種生物安全篩查必須依賴一個完備的潛在危險基因序列數據庫。早些時候,加拿大阿爾伯塔大學的研究人員通過郵件訂購DNA片段,成功構建了馬痘病毒(一種已滅絕的天花病毒),證明了該安全篩查系統的潛在脆弱性。馬痘病毒并沒有出現在潛在危險病毒清單上,研究本身(開發一種新型疫苗)也完全符合政府和大學的規定。然而,這項研究還是引發了一場熱議,生物安全和生物防御領域的許多專家公開質疑,現在的篩查工具是否已經完善,是否真的能夠阻止潛在的合成生物武器所帶來的威脅。

      2018年6月,總部位于波士頓的銀杏生物(Gingko Bioworks)公司宣布獲得價值高達6400萬美元的合同,為新興的合成生物學行業開發一系列生物安全產品,其中包括為基因合成公司改進用于篩選訂單的算法,開發用于識別DNA樣本是否進行了設計的深度學習模型。

      該公司計劃利用過去10年開發的用于識別有益DNA序列的算法,調整模型,用于預測DNA片段是否構成威脅。這些算法已經創造出了新的香味和能夠產生肥料的微生物。在美國情報高級研究計劃局(Intelligence Advanced Research Projects Agency)的支持下,該公司利用這些工具,在有潛在威脅的DNA序列被運送之前對其進行標記,并且能夠辨別一種新的病原體是自然進化的還是由人工設計的。銀杏生物擁有世界上最大的工程DNA序列數據庫,通過對這些數據的深度學習,識別被忽視的包含在這些設計中的工程特征。

      銀杏還獲得了國防部的資金,用于開發能夠感知和解除化學或生物威脅的酶。如果研究項目取得成功,公司將繼續推進這些產品和軟件工具的商業化。

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