鏈霉菌的次級代謝產物種類豐富，最重要的就是產生抗生素。現發現由鏈霉菌產生的抗生素有1000多種，已經應用于臨床的近百種，如鏈霉素(streptomycin)、卡那霉素(kanamycin)、絲裂霉素(mitomycin)，土霉素(oxytetmcycline)等。有的鏈霉菌能產生多種抗生素，還有一些種類能產生維生素、酶及酶抑制劑等。
