（一）某些酶的組分或活化劑
現已發現鋅是許多酶的組分。例如乙醇脫氫酶、銅鋅超氧化物歧化酶、碳酸酐酶和RNA聚合酶都含有結合態鋅。乙醇脫氫酶在高等植物體內是一種十分重要的酶。在有氧條件下，高等植物體內乙醇主要產生于分生組織（如根尖），缺鋅時植物體內的乙醇脫氫酶活性降低。關于銅鋅超氧化物歧化酶在本章第四節銅的營養生理作用中已有介紹。鋅也是許多酶的活化劑，在生長素形成中，鋅與色氨酸酶的活性有密切關系。在糖酵解過程中，鋅是磷酸甘油醛脫氫酶、乙醇脫氫酶和乳酸脫氫酶的活化劑，這都表明鋅參與呼吸作用及多種物質代謝過程。缺鋅還會引起植物體內硝酸還原酶和蛋白酶活性降低。總之，鋅通過酶的作用對植物碳氮代謝產生相當廣泛的影響。
（二）參與生長素的代謝
鋅在植物物體內的主要功能之一是參與生長素的代謝。試驗證明，鋅能促進吲哚和絲氨酸合成色氨酸，而色氨酸是生長素的前身，因此鋅間接影響生長素的形成。其簡單反應如下：
缺鋅時，作物體內吲哚乙酸（IAA）合成銳減，尤其是芽和莖中的含量明顯下降，作物生長發育即出現停滯狀態，其典型表現是葉片變小，節間縮短等癥狀，通常稱為“小葉病”或“簇葉病”。有試驗證明（Tsui，1948），缺鋅時番茄植株內色氨酸含量少，莖的伸長速率降低。有人進而發現在缺鋅的營養液中培養玉米，加鋅或加色氨酸均能消除缺鋅癥狀。因此許多資料都提出，色氨酸合成時需要鋅。但是，也有相反的報道，認為不是色氨酸合成需要鋅，而是色氨酸合成吲哚乙酸時需要鋅。
缺鋅導致IAA含量下降的原因至今仍無一致的解釋。很可能是由于缺鋅抑制了色氨酸的轉化，阻礙IAA向基部運輸以及促進了IAA的分解。最近還有人提出缺鋅導致氧自由基對IAA的分解作用。
（三）參與光合作用中CO2的水合作用
碳酸酐酶（CA）可催化植物光合作用過程中CO2的水合作用。其反應如下：
缺鋅時，植物的光合作用效率大大降低，這不僅與葉綠素含量減少有關，而且也與CO2的水合反應受阻有關。鋅是碳酸酐酶專性活化離子，它在碳酸酐酶中能與酶蛋白牢固結合。試驗表明，作物體內含鋅量與碳酸酐酶活性呈正相關。這種酶存在于葉綠體的外膜上，能催化CO2和H2O合成H2CO3，或使H2CO3脫水形成CO2。光呼吸過程中作物可釋放出H2CO3，而碳酸酐酶可捕捉H2CO3，釋放CO2，為光合作用提供底物。
鋅是醛縮酶的激活劑。醛縮酶是光合作用碳代謝過程中的關鍵酶之一。它能催化二羥丙酮和甘油醛-3-磷酸轉化為1，6-二磷酸果糖的反應，在葉綠體中使之進入淀粉合成的途徑，而在細胞質中使之向糖酵解支路——蔗糖合成途徑轉移。
（四）促進蛋白質代謝
鋅與蛋白質代謝有密切關系，缺鋅時蛋白質合成受阻。因為鋅是蛋白質合成過程中多種酶的組成成分。如蛋白質合成所必需的RNA聚合酶中就含有鋅。缺鋅會影響大豆蛋白態氮的含量，同時也反應在鮮重上。植物缺鋅的一個明顯特征是植物體內RNA聚合酶的活性提高。由此可見，缺鋅植物體內蛋白質含量降低是由于RNA降解加快所引起的。
（五）促進生殖器官發育和提高抗逆性
鋅對植物生殖器官發育和受精作用都有影響。鋅和銅一樣，是種子中含量比較局的微量元素，而且主要集中在胚中。在缺鋅介質中培養的豌豆不能產生種子。存澳大利亞進行的試驗表明，給三葉草增施鋅肥，其營養體產量可增加1倍，而種子和花的產量可增加近100倍。這足以證明了鋅對繁殖器官形成和發育所起的重要.
鋅可增強植物對不良環境的抵抗力。它既能提高植物的抗旱性，又能提高植物的抗熱性。缺鋅時，植物的蒸騰效率降低。鋅能增強高溫下葉片蛋白質構象的柔性。鋅在供水不足和高溫條件下，能增強光合作用強度，提高光合作用效率。此外，鋅還能提高植物抗低溫或霜凍的能力，因而有助于冬小麥抵御霜凍侵害，安全越冬。