載體主要有病毒和非病毒兩大類,其中質粒DNA是一種新的非病毒轉基因載體。
一、一個合格質粒的組成要素
? 復制起始位點Ori 即控制復制起始的位點。原核生物DNA分子中只有一個復制起始點。而真核生物DNA分子有多個復制起始位點。
? 抗生素抗性基因 可以便于加以檢測，如Amp+ ,Kan+
? 多克隆位點MCS 克隆攜帶外源基因片段
? P/E 啟動子/增強子
? Terms 終止信號
? 加poly（A）信號 可以起到穩定mRNA作用
二、如何閱讀質粒圖譜
第一步：首先看Ori的位置，了解質粒的類型（原核/真核/穿梭質粒）
第二步：再看篩選標記，如抗性，決定使用什么篩選標記。
（1）Ampr 水解β－內酰胺環，解除氨芐的毒性。
（2）tetr 可以阻止四環素進入細胞。
（3）camr 生成氯霉素羥乙酰基衍生物，使之失去毒性。
（4）neor（kanr） 氨基糖苷磷酸轉移酶 使G418（長那霉素衍生物）失活
（5）hygr 使潮霉素β失活。
第三步：看多克隆位點（MCS）。它具有多個限制酶的單一切點。便于外源基因的插入。如果在這些位點外有外源基因的插入，會導致某種標志基因的失活，而便于篩選。決定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。
第四步：再看外源DNA插入片段大小。質粒一般只能容納小于10Kb的外源DNA片段。一般來說，外源DNA片段越長，越難插入，越不穩定，轉化效率越低。
第五步：是否含有表達系統元件，即啟動子－核糖體結合位點－克隆位點－轉錄終止信號。這是用來區別克隆載體與表達載體。克隆載體中加入一些與表達調控有關的元件即成為表達載體。選用那種載體，還是要以實驗目的為準繩。
啟動子－核糖體結合位點－克隆位點－轉錄終止信號
? 啟動子－促進DNA轉錄的DNA順序，這個DNA區域常在基因或操縱子編碼順序的上游，是DNA分子上可以與RNApol特異性結合并使之開始轉錄的部位，但啟動子本身不被轉錄。
? 增強子/沉默子－為真核基因組（包括真核病毒基因組）中的一種具有增強鄰近基因轉錄過程的調控順序。其作用與增強子所在的位置或方向無關。即在所調控基因上游或下游均可發揮作用。/沉默子－負增強子，負調控序列。
? 核糖體結合位點/起始密碼/SD序列（Rbs/AGU/SDs）：mRNA有核糖體的兩個結合位點，對于原核而言是AUG（起始密碼）和SD序列。
? 轉錄終止順序（終止子）/翻譯終止密碼子：結構基因的最后一個外顯子中有一個AATAAA的保守序列，此位點down－stream有一段GT或T富豐區，這2部分共同構成poly（A）加尾信號。結構基因的最后一個外顯子中有一個AATAAA的保守序列，此位點down－stream有一段GT或T富豐區，這2部分共同構成poly（A）加尾信號。
回答有人之前提出的一個問題：為什么質粒圖譜上有的箭頭順時針有的箭頭逆時針，那其實是代表兩條DNA鏈，即質粒是環狀雙鏈DNA，它的啟動子等在其中一條鏈上，而它的抗性基因在另一條鏈上.
三、介紹一下關于載體的知識（雖然課本上都有寫）
1. 什么是載體
即要把一個有用的基因（目的基因——研究或應用基因）通過基因工程手段送到生物細胞（受體細胞），需要運載工具（交通工具）攜帶外源基因進入受體細胞，這種運載工具就叫做載體（vector）。
P.S.基因工程所用的vector實際上是DNA分子，是用來攜帶目的基因片段進入受體細胞的DNA
2. 載體的分類
―――按功能分成：（1）克隆載體 都有一個松弛的復制子，能帶動外源基因，在宿主細胞中復制擴增。它是用來克隆和擴增DNA片段（基因）的載體。（所以有時實驗時擴增效率低下，要注意是不是使用的嚴謹行載體）
（2）表達載體 具有克隆載體的基本元件（ori,Ampr,Mcs等）還具有轉錄/翻譯所必需的DNA順序的載體。
―――按進入受體細胞類型分：（1）原核載體 （2）真核載體 （3）穿梭載體（sbuttle vector） 指在兩種宿主生物體內復制的載體分子，因而可以運載目的基因（穿梭往返兩種生物之間）.
P.S. 穿梭質粒含原核和真核生物2個復制子，以確保兩類細胞中都能擴增。
3. 基因工程載體的3個特點：
（一）都能獨立自主的復制：載體DNA分子中有一段不影響它們擴增的非必需區域，如MCS，插在其中的外源DNA片段，能被動的跟著載體一起復制/擴增，就像載體的正常成分一樣。