1、造血系統：主要是骨髓抑制，白細胞及血小板減少，嚴重者可發生再生障礙性貧血或巨幼細胞性貧血；
2、白血病、淋巴瘤患者治療初期可發生高尿酸血癥，嚴重者可發生尿酸性腎病；
3、較少見的有口腔炎、食管炎、肝功能異常、發熱反應及血栓性靜脈炎。阿糖胞苷綜合癥多出現于用藥后6-12小時，有骨痛或肌痛、咽痛、發熱、全身不適、皮疹、眼睛發紅等表現。
