新型隱球菌在組織中呈圓形或卵圓形，直徑5～12μm，能保留革蘭染色；菌體為寬厚的莢膜所包裹，不形成菌絲和孢子，賴出芽生殖。新形隱球菌在室溫或37℃時易在各種培養基上生長，在沙保培養基上數天內即可長出菌落，呈乳白色，日久呈粘液狀。
根據其莢膜抗原性的不同，新型隱球菌有A、B、C和D四個血清型。國內以A型居多，次為B型和D型，未見C型。莢膜抗原能溶解在腦脊液、血清及尿中，可用特異性血清檢測。研究發現B/C型菌株耐5FC者較A／D型菌株為強。
