1.CT
平掃為等密度或稍高密度影，可為均勻一致的占位性病變，也可為不均勻甚至呈多囊性腫物，極少有鈣化。增強CT通常表現為中度到明顯的均勻一致的強化。
2.MRI檢查
鞍上生殖細胞瘤多自鞍內發展到鞍上，平掃可呈稍高信號，注藥可明顯強化。有的患者可出現明顯多飲多尿，MRI 上僅見垂體柄增粗或有米粒大的小腫物，經放療后垂體柄恢復正常。20%～58%的生殖細胞瘤有小囊變，這些囊變區由蛋白含量高的液體積聚或壞死液化的液體構成，通常較小，有時瘤內還有小出血灶，T1像為高信號。
3.腫瘤標志物測定
某些標志物在血清和腦脊液中增高對生殖細胞瘤的診斷有特殊的價值。如腫瘤標志物陰性，不能排除生殖細胞瘤，但如陽性對顱內生殖細胞瘤診斷有很大參考價值。腫瘤標志物在生殖細胞瘤中可檢測到很多種，臨床上測定較多的為甲胎蛋白（AFP）、β-絨毛膜促性腺激素（β-HCG）、癌胚抗原（CEA）、胎盤堿性磷酸酶（PLAP）等，這些標志物陽性說明存在生殖細胞瘤的可能性。