完全去除結石，消除其病因是最好的預防方法。但大多數尿石癥的病因難于根除。因此需長期注意預防。
1.飲食防石
養成多飲水的習慣，每日尿量2000～2500ml，外觀無色或淡黃色。根據結石成分和尿液分析結果選擇食物。過度營養者應降低熱量，尤其是減少動物蛋白的攝入，多食粗糧；吸收性高鈣者應限制乳制品、動物蛋白和糖；尿酸高者禁食動物內臟，少吃肉類。草酸高者禁食菠菜，少吃豆制品。
2.藥物防石
（1）降低結石鹽或酸在尿中飽和度的藥物噻嗪類藥物降尿鈣和草酸，別嘌醇類藥物降尿酸，硫醇類藥物降胱氨酸，正磷酸鹽類藥物可間接降鈣、鎂，枸櫞酸可絡合尿鈣，菌石通可以降低感染時尿液中的氨，并改變pH值。
（2）增加尿抑制活性的藥物枸櫞酸、正磷酸鹽等。
（3）干擾尿黏蛋白聚合控制促進活性的藥物乙酰半胱氨酸、丙氨酸等。
