1.藥物組分含量的分離和分析：由于藥劑通常含有組分，因此高效液相色譜儀方法是一種能夠分離和定量的方法。例如，脂溶性維生素片含有鉻維生素、C18柱和含有碳酸銨的甲醇流動相.每種維生素B6，D1，A和E可以同時分離并以單劑量確定。另一個例子是鎮痛劑或解熱劑，其可以分離并測量每種組分的含量。
2.藥品生產中的中間控制：生產抗生素時，首先要了解發酵液中主要和次要產品的存在。如青霉素、四環素、頭孢菌素、紅霉素、柔紅霉素、慶大霉素等發酵產物，可用流動相或離子對法，用C18柱、甲醇和緩沖液進行分析。可測定普魯卡因胺、茶堿和硝化甘油的主要含量，以保證藥品的熱值。
3.分析體內藥物殘留：是近年來新藥療效研究的重要內容之一。例如，麥地那龍是植物的組成部分，具有抗癌作用，但毒性很強。確定血清中的含量是非常重要的。現在，c18柱和甲醇水可以作為流動相來測定處理后的血清樣本，以獲得血液含量。例如，血清和尿液中磺胺類藥物的含量不允許過大。c18柱和酸性乙醇可作為流動相。確定含量后，可以估計出適當的劑量。另一個例子是四環素，巴比妥酸鹽，止痛藥，解熱藥，糖尿病藥，等等。用甲醇和水作為流動相，可以用c18柱測量血液或尿液中的含量。因此，反液相色譜儀法有廣泛的應用。
4.確定各種器官中藥物的代謝物，尤其是研究藥物在血清中的代謝物的存在。如血清酮酸和戊二酸。尿液中代謝物的測量是方便的，不需要復雜的預處理。由于尿液成分的研究能夠識別患者的代謝功能，對病理研究或臨床診斷具有重要的參考價值。
幾千年來，中國傳統醫學代代相傳。它在治療疾病方面也有神奇的療效，在世界醫學中占有重要地位。然而，中藥成分的復雜性和多樣性也制約著中藥制劑的開發和臨床應用。中醫藥的品種是創新的，但中醫藥的質量還遠遠沒有科學的量化。所有這些都需要一個精確的分析和檢測儀器。綜述了高效液相色譜儀在中藥制劑分析中的廣泛應用。它具有分離性能好、適用范圍廣、分析速度快、選擇性好、靈敏度高、樣品用量少等優點。隨著質譜和串聯質譜技術的逐步發展和完善，高效液相色譜儀技術將在中藥鑒定、中藥有效成分分析、中藥生產質量控制等方面發揮重要作用。冰毒及其制劑，成為分離、鑒定和含量測定的手段，具有廣闊的應用前景。近年來，高效液相色譜儀器、檢測器、固定相等方面取得了很大進展，極大地促進了藥物分析在中西藥中的應用。特別是對于中藥大寶庫來說，含量的質量指標難以制定，而高效液相色譜儀可以解決這一問題。然而，每種分析方法都有其適用范圍和方法。限制因素主要是高效液相色譜儀與其他技術的結合，如色譜法、色譜法、高效液相色譜儀-質譜法、柱切換法和高效液相色譜儀-傅立葉變換紅外吸收光譜法。