EDI高純水設備的良好的長期運行不僅依賴于系統的初期設計，而且取決于正確的運行和維護。這包含系統的初期啟動和運行過程中的啟動/停機。為了保持系統的長期良好運行，需要對系統運行數據進行定期記錄，以便日后日常運行維護。而且日常運行維護數據對于在設備故障判斷和決定采取何種措施方面有重要意義。
測試EDI高純水設備進水水質的下列指標：
進水水源：二級反滲透產水
進水當量電導率(包括CO2與Si)：<40μS/cm
硅：<1.0ppm以SiO2計
鐵，錳，硫：<0.01ppm
氯/氯化物：<0.02ppm以Cl2計
硬度：<1.0ppm以CaCO3計
溶解的有機物：<0.5ppm TOC中的C計
PH值：4-11
最大進水壓力bar：(1-45℃)
標準流量下壓差：1.4-2.1bar
標準回收率：90-95%
最高進水溫度：45℃
最低進水溫度：5℃
直流電壓(V)：0-600
直流電流(A)：0-6
運行啟動：
一旦EDI高純水設備系統已經啟動，每次的停機和重啟動都意味著壓力和流量的變化，以及對EDI模塊的機械性沖擊。因此，系統的停機和重啟動的次數應當盡可能的少，以保證EDI系統的平穩運行。在系統啟動之前和過程中的檢查應當作為一種日常工作進行，并且做好工作記錄。