高通量測序技術應用發展現狀

　　根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等，主要有以下幾種：大規模平行簽名測序(MassivelyParallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony Sequencing)、454焦磷酸測序(454 pyrosequencing)、Illumina(Solexa)sequencing、ABI SOLiD sequencing、離子半導體測序(Ion semiconductor sequencing)、DNA納米球測序 (DNA nanoballsequencing)等。

　　隨著第二代測序技術的迅猛發展，科學界也開始越來越多地應用第二代測序技術來解決生物學問題。比如在基因組水平上對還沒有參考序列的物種進行重頭測序(de novosequencing)，獲得該物種的參考序列，為后續研究和分子育種奠定基礎；對有參考序列的物種，進行全基因組重測序(resequencing)，在全基因組水平上掃描并檢測突變位點，發現個體差異的分子基礎。在轉錄組水平上進行全轉錄組測序(wholetranscriptome resequencing)，從而開展可變剪接、編碼序列單核苷酸多態性(cSNP)等研究；或者進行小分子RNA測序(small RNAsequencing)，通過分離特定大小的RNA分子進行測序，從而發現新的microRNA分子。在轉錄組水平上，與染色質免疫共沉淀(ChIP)和甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP)技術相結合，從而檢測出與特定轉錄因子結合的DNA區域和基因組上的甲基化位點。