腦炎；腦病；麻疹包涵體腦炎(MIBE)（參見【禁忌】)；亞急性硬化性全腦炎(SSPE)；格林-巴利綜合征(GBS)；熱性驚厥；無熱性驚厥或癲癇發作；共濟失調；多發性神經炎；多發性神經病變；眼性麻痹；感覺異常。
上市后應用的數據表明，在接種后30天內，極少出現在時間上與接種相關的明顯中樞系統反應，如腦炎和腦病。但提示以上一些病例可能由麻疹疫苗引起。接種麻疹活病毒疫苗之后出現此類嚴重的神經系統病癥的風險，遠低于野生型麻疹病毒引起的腦炎和腦病(1/2000)。
在過去的25年中（1971-1996），對全球使用了2億多人次的M-M-R和本品進行了上市后監測，結果表明，諸如腦炎和腦病等嚴重不良事件一直罕見報道。
對于從未感染野生型麻疹但接種了麻疹疫苗的兒童，有發生亞急性硬化性全腦炎（SSPE）的報道，這些病例中的一部分可能是由于在出生后的第1年中得過未確診的麻疹感染或接種過麻疹疫苗。根據估計的在本土范圍內麻疹疫苗分布情況，麻疹疫苗接種導致的SSPE相關病例的發病率約為1/100萬。它遠遠低于因野生型麻疹引發的SSPE（發病率6～22/100萬）。根據CDC進行的回顧性病例對照研究結果，認為麻疹疫苗的總體作用是通過預防內在SSPE高風險性的麻疹，以達到預防SSPE的目的。
接種麻疹、腮腺炎、風疹疫苗后已有無菌性腦膜炎病例報道。盡管已證實腮腺炎疫苗Urabe株與無菌性腦膜炎之間的因果關系，但尚無證據能表明本品中Jeryl Lynn腮腺炎疫苗與無菌性腦膜炎之間存在相關性。