目前，為了降低成本，加快時間，大部分癌癥基因檢測僅分析癌癥組織，并不分析生殖細胞DNA。這樣做可能會導致誤診誤斷。本文將就此問題進行一系列的分析探討。
據美國國家人類基因組研究所（NHGRI）和國家癌癥研究所（NCI）的研究表明，僅通過分析癌癥組織所得到的變異，其中就可能包含有生殖細胞變異，而這些變異會影響癌癥治療，建議實驗室為此做好準備。
臨床測序探索研究聯合會（CSER）腫瘤工作組得到了NHGRI和NCI資助，其研究人員主要來自密歇根大學、哈佛大學、俄亥俄州立大學、賓夕法尼亞大學、德克薩斯兒童癌癥中心和貝勒醫學院，他們制定了一系列關于實驗室進行癌癥測序檢測的指南，并將一些建議發表在《國家癌癥研究所期刊》（Journal of the National Cancer Institute）上。
據CSER工作組介紹，如果在實驗過程中沒有特地尋找生殖細胞變異，那么這些變異一旦被鑒定出來，就會對患者及其家屬的管理產生影響，因此實驗室應該注意這類變異。
本月初，紀念Sloan Kettering癌癥中心的研究者報告稱，通過使用包含341個基因的panel對腫瘤DNA的分析發現，16%的患者有致病性生殖細胞變異。另外，許多患者所檢測出跟癌癥風險相關的變異其實也是生殖細胞變異。這些生殖細胞變異也會影響患者的治療和家屬患癌風險的預測。
4月，約翰霍普金斯大學的研究者報告稱，在沒有與正常樣本對照進行分析的時候，3%的患者所鑒定出的腫瘤變異實際是生殖細胞變異。
問題如何解決？
在CSER工作組的一篇文章中，研究人員表示：“不用直接分析生殖細胞DNA，僅從癌癥組織測序結果中來識別和推斷出生殖細胞變異，這一點能否實現是很重要的。”他們提供了這樣的實例和實驗室應該考慮的相應問題。
首先，癌癥panel中通常包括一些比較公認的遺傳性癌癥突變基因，例如BRCA1、BRCA2和Lynch綜合征的突變基因。
其次，一些變異模式也暗示著潛在的生殖細胞變異。例如，超突變腫瘤中DNA錯配修復基因突變通常意味著生殖細胞變異，小兒成神經管細胞瘤中大型染色體重排也暗示著生殖細胞TP53基因變異。
另外，很多基因變異在生殖細胞和體細胞中都能觀察到，這類基因通常為癌癥易感性基因，包括MSH2、ALK、RB1、TP53和VHL。
生殖細胞變異，臨床應格外注意
研究人員介紹，“鑒于變異分析和臨床解讀相結合的必要性，我們認為，醫生和實驗室應該共同解決生殖細胞變異的這一問題。”
工作組還建議，為癌癥患者進行癌癥panel、外顯子或全基因組測序分析的實驗室應該搭建生物信息學平臺，用來鑒定生殖細胞變異。另外，實驗室還應該制定適當的策略，用于證實潛在的生殖細胞變異。制定這套策略時應當考慮：如何從患者那里獲得生殖細胞樣本；實驗室自己做檢測還是與診斷機構合作。總之，實驗室應該為鑒定生殖細胞變異制定一種標準化的方法。
此外，醫生也有責任告訴患者，這種基因檢測可能會發現遺傳性突變，進而會對他們的治療和家屬患癌風險評估產生影響。醫生也需要擬定一個方案，如何告訴患者生殖細胞變異的結果。
總而言之，由于基因檢測可能會受到生殖細胞變異的影響，醫生和實驗室應該尋找有效的解決方案，以減少對患者的誤診。