近日，“自然亞洲”(natureasia)網站發布了“2012年亞太地區自然出版指數”的報告，日本東京大學名列第一，中國科學院第二。在排名前十位的機構中，日本占了6家，中國2家，澳大利亞和新加坡各1家。
該排名基于2012年在《自然》雜志及其子刊發表的原始研究文章進行統計，分別計算出各研究機構發表文章數量和貢獻點數。此排名則是以貢獻點數(corrected count)為標準。
據了解，科研機構和科研城市的貢獻點數計算方法如下：每篇論文為1分，假定每個作者在每篇文章中的貢獻是等同的，分數歸屬其所依托的科研機構。如一篇文章有4個作者，其中2個作者來自中科院，中科院將從該論文獲得0.5分。
“自然亞洲”網站分析稱，許多年來，日本一直主導亞太地區的科研;但是，通過自然出版指數的數據來看，亞太地區高質量的研究正在轉向中國、新加坡等國。比如，2011年排名第一的東京大學貢獻點數為42.82，中國科學院為22.52，而2012年，東京大學貢獻點數為39.72，中國科學院為 37.88。據最新的(2012年3月19日至2013年3月18日)分析，中國科學院以48.92的貢獻點數，超越東京大學(貢獻點數為35.62)，穩居亞太地區第一名。
從世界范圍的排名來看，哈佛大學以152.11的貢獻點數高居第一，比第二名的斯坦福大學高出75.77。德國馬普研究院、法國國家科研中心和美國國立衛生研究院分列第三、五、六名，東京大學和中國科學院分列第八和第十二名。
該報告還發布了在《自然》及各子刊發文機構前五名以及日本、中國、澳大利亞、韓國和新加坡的國內機構排名。中國研究機構的排名，位于前十位的分別是中國科學院、中國科技大學、清華大學、北京大學、上海交通大學、華大基因、浙江大學、華中科技大學、復旦大學和香港大學。