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  • 發布時間:2019-03-27 14:46 原文鏈接: 2.2.3綠色葉片植物葉線粒體RNA的分離

    實驗方法原理利用差速離心,將線粒體從其他亞細胞結構中分離出來,再用蔗糖梯度離心進一步純化得到線粒體。用核糖核酸酶 A 處理從中去除葉綠體 RNA,然后加入高濃度硫氰酸胍滅活核糖核酸酶 A,硫氰酸胍作為一種蛋白變性劑可非常有效的滅活核糖核酸酶 A。通過 CsCl 梯度離心,線粒體 RNA 沉淀下來。最后用 LiCl 沉淀法,將 CsCl 梯度離心中共沉淀下來的單鏈 DNA 是從線粒體 RNA 中除去。
    試劑、試劑盒

    5.7moI LCsCl 溶液10 mmol LEDTApH7.5DEPC 水變性緩沖液EB抽提緩沖液4mol L 硫氰酸胍7.5mol L 鹽酸胍2mol L 和 4mcL LLiCl上樣緩沖液10XMOPS 緩沖液2mol L 乙酸鉀2mol L 乙酸鈉5% 十二烷基肌氨酸鈉TE 緩沖液洗脫緩沖液

    儀器、耗材

    勻漿器

    實驗步驟

    一 材料與設備

    溶液均用 DEPC 水配制:

    1)5.7moI/LCsCl 溶液。

    2)10 mmol/LEDTA,pH7.5

    3)DEPC 水

    4) 變性緩沖液:50% 甲酰胺,12% 甲醛,IXMOPS 緩沖液(40 mmol/LMOPS,10 mmol/L 乙酸鈉,lmmol/LEDTA,pH7.0),用前新鮮混合。

    5)lmg/mlEB

    6) 抽提緩沖液:0.35mol/L 山梨醇,50 mmol/LTris-HCl(pH8.0).5 mmol/LEDTA,0.1%BSA,0.25 mg/ml 精胺和亞精胺,儲存于用前加巰基乙醇至終濃度 0.2%。

    7)4mol/L 硫氰酸胍:100 mmoI/LTris-HCl(pH7.5),用前加巰基乙醇至 1%(終濃度),4°C 保存。

    8)7.5mol/L 鹽酸胍:含 10 mmol/LDTT,NaOH 調至 pH7.5, 過濾 4℃ 保存

    9)2mol/L 和 4mcL/LLiCl,4℃ 保存

    10) 上樣緩沖液:50% 甘油,0.25% 溴酚藍,lmmol/LEDTA。

    11)10XMOPS 緩沖液:0.4moI/LMOPS,0.lmol/L. 乙酸鈉,10 mmol/LNa2EDTA,pH7.0。

    12)2mol/L 乙酸鉀:pH5.

    13)2mol/L 乙酸鈉:pH7.5。

    14)5% 十二烷基肌氨酸鈉。

    15)TE 緩沖液:10 mmol/L—Tris-HCl(PH8.0),1 mmol/LEDTA

    16) 洗脫緩沖液:350 mmol/L 山梨醇,50 mmol/LTris-HCl(pH8.0),20 mmol/LEDTA

    17) 勻漿器


    二 操作方法

    1. 線粒體的分離

    所有步驟均在℃ 進行。溶液. 試劑瓶等要置于冰上。

    1) 從油菜或其他植物中采集 4?6 周的新鮮綠色葉子 20 g. 剪碎,置于 200 ml 冰冷的抽提緩沖液中冷卻。

    2) 在勻漿器中島速勻漿組織三次〔每次勻漿每次間隔 l0S)。用兩層濾膜將勻漿濾入 250 ml 冷的離心瓶中。

    3)2000 g 離心過濾物 lOmin。小心地將上清液移入另一新管,10000 g 離心 20 min

    4) 將沉淀再懸浮于 100 ml 柚提緩沖液中,重復步驟 3)—次。

    5) 將線粒體沉淀再懸浮于 20 ml 冷的洗脫緩沖液中

    6) 將每 10 ml 線粒體懸浮液,小心地置于蔗糖梯度的上面(蔗糖梯度組成為:9 ml0.9mol/L,11 ml1.5mol/L,9 ml1.75mol/L,蔗糖溶于洗脫緩沖液中)8O000 g 離心 60 min. 用寬孔吸管從 0.9mol/L 和 1.5mol/L 蔗搪界面 (黃帶)收集線粒體,用 5 倍的洗脫緩沖液稀釋 15?20 min

    7)10000 g 離心 20mim 沉淀線粒體。將線粒體沉淀再懸浮于 1 ml 冷的洗脫緩沖液中。


    2. 線粒體 RNA 的分離

    1) 將線粒體與 20ug/ml 核糖核酸酶 A 于冰上共同孵育 60 min

    2) 向線粒體中加入 5 倍體積的 4mol/L 硫氰酸胍。60s 后室溫下加入 0.5 倍體積的 5% 十二烷基肌氨酸鈉,混勻。5000 g,5 min 離心混合物,除去不溶件殘余物。

    3) 將每 3.2 ml 混合物置于 1.lmlDEPC 處理的 5.7mol/LCsCl 溶液中。

    4)22000 g 超速離心 14 h。

    5) 仔細吸出上清液,并將與勻漿接觸的離心管的上部切除 (所有步驟應避免手上的核糖核酸酶 A 的污染)

    6) 加人 lml7.5mol/L 鹽酸胍,充分混勻,溶解 RNA 沉淀。

    7) 混合物內加入 0.05 倍體積的 2mol/L 乙酸鉀(PH5.5) 和 0.5 倍體積的乙醇。

    8)?20℃ 孵肓 4 h.5000 g 離心 lOmin,沉淀線粒體 RNA

    9) 加入 0.1 倍體積的 2moL/L 乙酸鈉 (pH7.0) 和 2.5 倍體積的乙醇,-20℃ 過夜,10000 g 離心 30 min。

    10) 用 70% 乙醇洗滌線粒體 RNA, 真空干燥,溶解于 0.5 mlTE。

    11)為獲得不含單鏈 DNA 的線粒體 RNA, 加入等體積的 4mol/LLiCl 溶解 RNA,4℃ 孵育過夜,10000 g 離心 20 min. 用 2mol/LiC1 洗滌一次,70% 乙醇洗滌兩次。

    12) 真空干燥線粒體 RNA, 溶解于 DEPC 處理過的水中。測量 260nm 的吸光度佔算線粒體 RNA 的得率 n

    13) 為長期儲存,在線粒體 RNA 中加 0.3 倍體積的乙酸鈉,2.5 倍體積的無水乙醇, 存放于每克新鮮葉子可提取 0.3?0.5ug 線粒體 RNA.




    收起 
    注意事項

    1) 操作過程中戴塑料或乳膠手套,所有試劑僅用于 KNA 提取,避免核糖核酸酶的污染。所有的玻璃器皿在 160℃ 處理 4 h。所用的塑料器皿用硫氰酸胍處理后,浸于 0.2%DEPC 水中 12 h, 高壓消毒。

    2) 為蔗糖梯度離心準備的梯度液應 4℃ 過夜平衡。梯度離心后,將洗脫緩沖液緩慢加人到收集到的線粒體中(15?20mim), 這可減少滲透性休克。

    3) 由于單鏈 DNA 與 RNA 在梯度中同時沉淀下來,所以要獲得純化的 RNA 必須進行 2moL/LiC1 沉淀

    4) 可直接用純的甲酰胺試劑。若出現黃色, 用 5%(m/V) 樹脂 501-X8(D)(BioRad) 處理 lh 以去除離子。過濾后的去離子甲酰胺應儲存在-70°C


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