CRISPR新應用：尋找基因調控元件
人體內所有的組織都是由蛋白質構成的，每一種蛋白質都是由人類基因組中一段DNA“編碼”的。 但是這些編碼區僅占基因組的大約百分之1，而分散在基因組中的其他百分之99的序列，參與了調節基因的表達，或決定哪些編碼區將被翻譯成蛋白質，以及何時被翻譯。 1月25日在《Nature Biotechnology》雜志發表的一項研究中，麻省理工學院（MIT）和哈佛醫學院的研究人員描述了一種新的技術，可系統而有效地在長的基因組片段中尋找調控元件。在這項技術的第一次應用過程中，他們發現了證據表明，當前人們對于基因調控的看法是不完整的。 本文資深作者、麻省理工學院電氣工程和計算機科學教授David Gifford說：“傳統的檢測方法是將基因組切成小片段，并探討它們是否足以推動基因的表達。這有兩個局限性。第一，可能一些事情足以激活基因，但這并不意味著它是必要的。反之亦然：如果有什么事情是必要的，它可能就不是充足的。所以這些實驗確實沒有揭示關于......閱讀全文
基因的分類及對應基因編碼蛋白質的作用
把基因區分為結構基因和調節基因是著眼于這些基因所編碼的蛋白質的作用：凡是編碼酶蛋白、血紅蛋白、膠原蛋白或晶體蛋白等蛋白質的基因都稱為結構基因；凡是編碼阻遏或激活結構基因轉錄的蛋白質的基因都稱為調節基因。但是從基因的原初功能這一角度來看，它們都是編碼蛋白質。根據原初功能（即基因的產物）基因可分為：①編
NRG1基因編碼蛋白質的結構和作用
該基因編碼的蛋白質是一種膜糖蛋白，可調節細胞信號傳導，并在多器官系統的生長和發育中起到關鍵作用。通過選擇性啟動子的使用和剪接，該基因產生了一種不同亞型的特殊變體。這些亞型以組織特異性的方式表達，在結構上有顯著差異，分為I型、II型、III型、IV型、V型和VI型。這種基因的失調與癌癥、精神分裂癥和雙
科學家首次發現線粒體基因編碼第14個蛋白質
5月3日，《細胞—代謝》（Cell Metabolism）刊發了中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員劉興國團隊與合作者最新研究成果。他們改寫了教科書中“線粒體基因組編碼13個蛋白”的論斷，首次發現線粒體基因編碼第14個蛋白質的“線粒體約定”新模式。“我們在研究中發現并證明了線粒體基因細胞色素b（
科學家首次發現線粒體基因編碼第14個蛋白質
中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員劉興國團隊與合作者，首次發現線粒體可使用細胞質標準密碼翻譯第14個功能蛋白，打破了傳統觀點認為的線粒體基因只翻譯13個蛋白的定律。相關研究近日發表于《細胞-代謝》。 “我們在研究中發現并證實，除13個線粒體基因編碼的蛋白質外，線粒體基因細胞色素b（CYT
相同基因編碼的不同蛋白質亞型或許發揮著多樣的功能
對于兄弟姐妹而言他們看似相似但實際上卻并不相同，比如有些會成為花匠，有些會成為笛手，又有些會成為物理學家；當然相同的多樣性也同樣適用于人類單一細胞產生的蛋白質中，近日一項刊登于雜志Cell上的一項研究論文中，來自加利福尼亞大學等處的科學家進行了一項大規模性的研究，結果發現，由相同基因編碼產生的“兄弟
我國科學家首次發現線粒體基因編碼第14個蛋白質
熱熱鬧鬧的線粒體大廠中，線粒體基因細胞色素b(CYTB)兄弟的一項全新能力，已被我國科學家解鎖出來。5月3日，國際期刊《細胞－代謝》刊發了中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院劉興國課題組的該項研究成果。他們首次發現并證實了線粒體基因細胞色素b可編碼一個新的線粒體基因編碼胞質翻譯的蛋白CYTB-187A
基因組所開發出編碼蛋白質DNA序列并行比對工具ParaAT
中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室“百人計劃”章張研究員，帶領其團隊成功開發出“編碼蛋白質DNA序列并行比對工具—ParaAT（Parallel Alignment and back-Translation）”。該研究成果發表在Biochemical and Biop
《Nature－Biotechnology》新發現一批人類特異性蛋白質編碼基因
2001年，人類基因組計劃(Human Genome Project)的研究人員繪制了人類的基因藍圖，他們驚訝地發現，只有大約2萬個基因能產生蛋白質。難道人類的基因只有普通小蒼蠅的兩倍嗎?科學家們預期，遠不止這些。現在，來自世界各地20個機構的研究人員匯集了超過7200個未被識別的基因片段，這些片段
－牛津大學校刊：人類蛋白質編碼基因數量降至1.9萬
7月10日消息，據Science Daily報道，人體蛋白質的編碼基因數量最早估計有10萬個左右，人類基因組計劃將其數量減少到了2萬個左右。而最新研究再次將這一數量減少到了1.9萬。 研究負責人、西班牙國立癌癥研究中心的Alfonso Valencia說，幾年前無人會想到，如此少的基因會創造出
廣州健康院發現線粒體基因編碼第14個蛋白質的“線粒體約定”新模式
5月3日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院劉興國課題組在《細胞-代謝》（Cell Metabolism）上發表了題為A novel protein CYTB-187AA encoded by the mitochondrial gene CYTB modulates mammalian early
調整基因編碼蛋白的檢測
實驗步驟展開
調整基因編碼蛋白的檢測
實驗步驟 ? ? ? ? ? ? 展開
調整基因編碼蛋白的檢測
實驗步驟 ? ? ? ? ? ? 展開
Science、EMBO重要發現：編碼蛋白質的lncRNAs
不久之前，研究人員還認為RNA分為兩類：生成蛋白質的編碼RNAs和發揮結構作用的非編碼 RNAs。發現小分子RNAs開啟了全新的研究領域。然而現在研究人員兜了個圈又回到了原地，推測一些長鏈非編碼RNAs可能生成了具有生物功能的小蛋白。近期發表在《EMBO Journal》雜志上的一項研究
利用LCMS/MS等方法－發現線粒體基因組編碼蛋白質的新模式
圖 線粒體編碼基因CYTB的雙重翻譯模式 在國家自然科學基金項目（批準號：92254301、92357302、32025010）等資助下，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院劉興國研究員團隊在線粒體基因組編碼研究方面取得進展，研究成果以“線粒體基因CYTB編碼的新蛋白質CYTB-187AA調控哺乳動
GenOrigin——一種多物種蛋白質編碼基因起源與演化的數據庫
2021年6月14日，JGG在線發表了華中農業大學陳振夏教授課題組題為“GenOrigin: A Comprehensive Protein-coding Gene Origination Database on the Evolutionary Timescale of Life”的研究論文。
ATM正相關基因編碼功能描述
ATM基因編碼的蛋白屬于PI3/PI4激酶家族，這種蛋白是一種重要的細胞周期檢查點激酶，通過磷酸化調控下游一系列重要蛋白，包括抑癌蛋白p53和BRCA1、檢查點激酶CHK2、檢查點蛋白RAD17和RAD9以及DNA修復蛋白NBS1。ATM和與其密切相關的蛋白ATR被認為是在細胞周期調控以及DNA損傷
ATR正相關基因編碼功能描述
該基因編碼的蛋白屬于PI3/PI4激酶家族，與ATM（一種在共濟失調性毛細血管擴張癥中突變的基因編碼的蛋白激酶）關系最為密切。這種蛋白和atm與pombe-rad3裂殖酵母菌（schizosaccharomyces pombe rad3）具有相似性，后者是細胞周期停滯和DNA損傷修復反應中所需的細胞
POLE正相關基因編碼功能描述
該基因編碼DNA聚合酶epsilon的催化亞單位。這種酶參與DNA修復和染色體DNA復制。該基因突變與結直腸癌12和面部畸形、免疫缺陷、利維多和身材矮小有關。This gene encodes the catalytic subunit of DNA polymerase epsilon. The
ALK負相關基因編碼功能描述
ALK基因編碼一種受體酪氨酸激酶(eceptor tyrosine kinase ,RTK)，為跨膜蛋白，屬于胰島素受體超家族，在大腦發育與及特定的神經元中起重要作用。最初在間變性大細胞淋巴瘤（anaplastic large cell lymphoma, ALCL）發現ALK-NPM1融合蛋白，目
APC負相關基因編碼功能描述
APC為抑癌基因，所編碼的蛋白在Wnt信號通路中起負調控作用，也參與到細胞遷移、粘附、轉錄激活和凋亡中。這個基因缺陷導致家族性腺瘤性息肉（FAP），這是一種常染色體顯性遺傳疾病，通常易發生癌變，主要機制為突變的APC基因缺失了與Axin的結合序列，因而不能與Axin、CK1和GSK-3β形成β-ca
EGFR負相關基因編碼功能描述
EGFR編碼的蛋白是一種跨膜糖蛋白，也是表皮生長因子受體家族中的一員，該家族包括HER1（erbB1，EGFR）、HER2（erbB2，NEU）、HER3（erbB3）及HER4（erbB4），也屬于受體酪氨酸激酶家族。EGFR作為細胞表面蛋白可與配體如表皮生長因子（EGF）結合，EGFR可被激活，
PTEN負相關基因編碼功能描述
PTEN基因編碼的蛋白具有蛋白磷酸酶和脂質磷酸酶活性，是第一個具有磷酸酶活性的抑癌基因，也是是繼p53和Rb基因之后，與腫瘤發生密切相關的一種抑癌基因，其主要機制因為PTEN是PI3K/Akt通路的主要負調控因子。PTEN的功能缺陷在人類多種腫瘤中廣泛存在。
APOE基因編碼功能及結構描述
這個基因編碼的蛋白質是乳糜微粒的一個主要的凋亡蛋白。它與特定的肝臟和外周細胞受體結合，對富含甘油三酯的脂蛋白成分的正常分解代謝至關重要。該基因與載脂蛋白C1和C2基因簇中的19號染色體定位該基因突變導致家族性β-脂蛋白血癥或Ⅲ型高脂蛋白血癥（HLP-Ⅲ），其中血漿膽固醇和甘油三酯升高是乳糜微粒和極低
ATR基因編碼功能及結構描述
該基因編碼的蛋白屬于PI3/PI4激酶家族，與ATM（一種在共濟失調性毛細血管擴張癥中突變的基因編碼的蛋白激酶）關系最為密切。這種蛋白和atm與pombe-rad3裂殖酵母菌（schizosaccharomyces pombe rad3）具有相似性，后者是細胞周期停滯和DNA損傷修復反應中所需的細胞
ATRX基因編碼功能及結構描述
該基因編碼的蛋白含有一個atpase/螺旋酶結構域，因此屬于染色質重塑蛋白的swi/snf家族。這種蛋白被發現經歷了細胞周期依賴性磷酸化，它調節其核基質和染色質的結合，并表明它參與有絲分裂的間期基因調節和染色體分離。該基因突變與X連鎖精神發育遲滯（XLMR）綜合征有關，通常伴有α-地中海貧血（ATR
BAD基因編碼功能及結構描述
這個基因編碼的蛋白質是bcl-2家族的一員。bcl-2家族成員是細胞程序性死亡的調節者。該蛋白通過與bcl-xl和bcl-2形成異二聚體，并逆轉其死亡抑制活性，從而對細胞凋亡起到積極的調節作用。這種蛋白的促凋亡活性是通過磷酸化調節的。蛋白激酶akt和map激酶以及蛋白磷酸酶鈣調磷酸酶參與了該蛋白的調
BLCAP基因編碼功能及結構描述
這個基因編碼一種通過刺激細胞凋亡來減少細胞生長的蛋白質。選擇性剪接和選擇性啟動子的使用導致編碼相同蛋白質的多個轉錄變體。這個基因在大腦中留下印記，在那里不同的轉錄變體從每個父母等位基因表達。上游啟動子起始的轉錄變異體優先從母體等位基因表達，而散布的NNAT基因（GeneID:4826）下游起始的轉錄
BLM－基因編碼功能及結構描述
bloom綜合征基因產物與含有dna解旋酶的desh盒recq亞群有關，具有dna刺激的atp酶和atp依賴的dna解旋酶活性。引起布魯姆綜合征的突變會刪除或改變螺旋酶基序，并可能使3'-5'螺旋酶活性喪失。正常蛋白可能起到抑制不適當重組的作用。[由RefSeq提供，2008年7月]
EED基因編碼功能及結構描述
該基因編碼一個多囊組（pcg）家族成員。pcg家族成員形成多聚蛋白復合物，參與維持基因在連續細胞世代中的轉錄抑制狀態。該蛋白與zeste 2的增強子、整合素beta7的細胞質尾、免疫缺陷病毒1型（hiv-1）ma蛋白和組蛋白脫乙酰酶蛋白相互作用。該蛋白通過組蛋白去乙酰化介導基因活性的抑制，并可能作為
