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  • 發布時間:2019-04-28 20:43 原文鏈接: NP40以及菌體/細胞裂解法1

    細胞裂解分析化學,論壇,化學分析,儀器分析,分析測試,色譜,電泳,光譜u5kLlIO
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    采用溫和的裂解條件,不能破壞細胞內存在的所有蛋白質-蛋白質分析化學論壇~O/b:te}
      相互作用,多采用非離子變性劑(NP40或Triton X-100)。每種細胞的裂解條件是不一樣的,通過經驗確定。
      不能用高濃度的變性劑(0.2%SDS),細胞裂解液中要加各種酶抑制劑,如商品化的cocktailer。
     
    2、如何得到比較純的包涵體
    對于包涵體的純化,包涵體的前處理是很重要的。
    包涵體中主要含有重組蛋白,但也含有一些細菌成分,如一些外膜蛋白、質粒DNA和其它雜質。洗滌常用1%以下的中性去垢劑,如Tween、Triton、Lubel和 NP40等加EDTA和還原劑2-巰基蘇糖醇(DTT)、β-巰基乙醇等反復多次進行,因去垢劑洗滌能力隨溶液離子強度升高而加強,在洗滌包涵體時可加50 mM NaCL。這樣提取的包涵體純度至少可達50%以上,而且可保持元結構。也可用低濃度的鹽酸胍或尿素/中性去垢劑/EDTA/還原劑等洗去包涵體表面吸附的大部分不溶性雜蛋白。洗滌液pH以與工程菌生理條件相近為宜,使用的還原劑為0.1-5mM。EDTA為0.1-0.3 mM。去垢劑如Triton X-100、脫氧膽酸鹽和低濃度的變性劑如尿素充分洗滌去除雜質,這一步很重要,因為大腸桿菌外膜蛋白Omp T(37 KDa)在4-8mol/L尿素中具有蛋白水解酶活性,在包涵體的溶解和復性過程中可導致重組蛋白質的降解。
    1.2.5 DNA片段分析 SGC-7901感染Ad-p27mt和Ad-LacZ 48 h后離心去上清, 在剩余細胞沉淀中加500 mL的細胞裂解液(10 g/L Np40, 20 mmol/L EDTA, 50 mmol/L Tris-HCl(pH 7.5)]和10 mL蛋白酶K. 在56℃水浴中加熱1-2 h, 用苯酚和氯仿提取, 然后用脫水酒精沉淀DNA. 在700 mL/L酒精洗滌一次后加入200 mL TE. 然后再加入RNA酶(最終濃度為50 mL/L), 37℃下過夜. 然后在10
     
    1.3   DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測細胞凋亡   1×106細胞在含50μg/ml順鉑的培養液中培養12h,離心沉淀后,加入細胞裂解液(1% NP40,20mmol/L EDTA pH8.0,50mmol/L Tris-cl pH7.5),離心取上清加入10%SDS、蛋白酶K,50℃孵育2h,再加入RNase A室溫放置1h。酚、氯仿抽提,取10μl DNA, 70℃放5min后,15g/L瓊脂糖凝膠,4V/cm電泳3h,觀察結果并照像保存。
    一、反復凍融法:
    1、將細胞在-20度以下冰凍,室溫融解,反復幾次,由于細胞內冰粒形成和剩余細胞液的鹽濃度增高引起溶脹,使細胞結構破碎。

    2、至少3次以上凍溶。

    3、IFCC推薦法:
    收集細胞懸液,4℃低溫離心(3000rpm,5min),棄上清,加入一定量PBS(200ul),輕輕吹打混勻,-200C 冷凍30 min,370C 解凍,如此反復3次,可形成細胞裂解液。

    4、用液氮凍融三四次就可以了,細胞凍住后,取出放37度水浴,溶解后震蕩,再凍


    二、超聲波處理法
    1、要設定好超聲時間和間隙時間,一般超聲時間不超過5秒,間隙時間最好大于超聲時間,這些都有利于保護酶的活性。我的實驗超聲時間5秒、間隙時間10秒、工作次數20次。

    2、每個樣本超聲時間5秒,每個間隔5秒,粉碎5次。

    3、100ml菌液離心,用8ml緩沖液懸浮,加8mg溶菌酶,冰浴30min,然后超聲處理。750W 40%功率。5秒超聲,9秒間隔。超聲至少90min。

    4、綜合凍融和超聲的方法:
    1500g離心,棄除上清。冰上,用小體積PBS重懸細胞。
    將重懸液集中,1500g離心濃縮,棄除上清。液氮驟冷。用約5倍體積的PBS緩沖液重懸細胞,并攪拌。
    可選擇:4℃下超聲破碎細胞。加入終濃度為0.25M的KCl,15mM的DTT。4℃下111500g×60min離心裂解液。取出上清。過柱子。
    Purification of GST-Fusion Proteins from E. coli-Alternate Protocol

    三、滲透法:
    冰冷的20 mmol/L Tris-Cl(pH8.0),2.5 mmol/L EDTA處理,冰浴放置10min。
    《精編分子生物學實驗指南》

    四、裂解液處理法:
    1、細胞裂解液:50 mmol/L Tris-Cl pH 6.8,100 mmol/L DTT,2% SDS,0.1%溴酚藍,10%甘油。SDS是陰離子型表面活性劑、極易促溶、強變性作用。

    2、在loading buffer加SDS,100度5分鐘,是變性方法。SDS與蛋白等量結合,可以通過條帶位移判斷蛋白大小,考染不會影響結果。

    3、如果是做小量菌液,跑PAGE膠看其表達情況的話,可以直接加蛋白loading buffer煮沸5分鐘即可,需注意的是上樣前要離心12000rpm至少5分鐘,然后上樣時,槍頭別吸最底下的。


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