微衛星DNA分子標記及其應用(一)
微衛星(Microsatellite,MS)又稱短串聯重復(Short Tandem Repeats,STR)或簡單序列重復(Simple Sequnce Repeat,SSR),是指基因組中以少數幾個核苷酸(多數為2-4個)為單位多次串聯重復組成的長達幾十個核苷酸的序列。其中最常見的是雙核苷酸重復,如(AC)n、(TG)n等,微衛星DNA廣泛分布在真核生物的基因組中,大約每隔10-550kb就存在一個微衛星。微衛星DNA由于具有特異性的PCR擴增、多態信息容量(PIC)高、引物通用性好、突變率高、共顯性等特點,已經被廣泛應用。 1.微衛星DNA的特點及分類 微衛星DNA具有豐富的多態性,主要表現在核苷酸重復單位數目的多態性和重復序列中核苷酸的替換多態性。一般認為,一個微衛星DNA核心序列重復數目越高,其等位基因數目也就越多,多態性就越豐富。微衛星DNA遵循孟德爾遺傳規律,能夠穩定地從上一代傳給下一代,且等位基因間呈現共......閱讀全文
微衛星DNA分子標記及其應用
微衛星(Microsatellite,MS)又稱短串聯重復(Short Tandem Repeats,STR)或簡單序列重復(Simple Sequnce Repeat,SSR),是指基因組中以少數幾個核苷酸(多數為2-4個)為單位多次串聯重復組成的長達幾十個核苷酸的序列。其中最常見的是雙核苷酸
微衛星DNA分子標記及其應用(一)
微衛星(Microsatellite,MS)又稱短串聯重復(Short Tandem Repeats,STR)或簡單序列重復(Simple Sequnce Repeat,SSR),是指基因組中以少數幾個核苷酸(多數為2-4個)為單位多次串聯重復組成的長達幾十個核苷酸的序列。其中最常見的是雙核
微衛星DNA分子標記及其應用(二)
3. 微衛星分子標記技術的應用 微衛星DNA 作為遺傳標記具有很大的優越性。近年來隨著研究的不斷深入,對微衛星標記的研究不僅具有重要的理論意義, 而且還具有較好的應用前景。3.1 微衛星多態性分析在自然界中,生物個體表現出來的各種遺傳變異,在本質上就是DNA 的差異,因此通過研究DNA的變異來分
微衛星標記的分類
Weber 將微衛星分為3 類:單純(pure) SSR、復合(compound) SSR,和間隔(interrupted) SSR。所謂單純SSR 是指由單一的重復單元所組成的序列,如(AT) n;復合SSR 則是由2 個或多個重復單元組成的序列,如(GT)n(AT)m;間隔SSR 在重復序列中有
微衛星標記的概念
微衛星標記(microsatellite),又被稱為短串聯重復序列(short tandem repeats,STRs)或簡單重復序列(simple sequence repeats,SSR),是均勻分布于真核生物基因組中的簡單重復序列,由2~6個核苷酸的串聯重復片段構成,由于重復單位的重復次數在個
微衛星標記的實驗步驟
1. 客戶收集標本(血液或組織等標本)并提取DNA。2. 設計引物序列并擴增,瓊脂糖電泳檢測結果。3. 合成熒光標記引物。4. 進行PCR擴增,產物通過測序儀器電泳檢測, 獲得擴增片段大小。5. 分析測序儀器讀出的數據,給結果圖譜。
序列標記微衛星的定義
中文名稱序列標記微衛星英文名稱sequence tagged microsatellite;SIMS定 義染色體上已定位的、核苷酸序列已知的微衛星重復序列。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
微衛星標記法的特點
與其它標記技術相比,具有以下特點:首先,在每個微衛星DNA?兩端的序列多是相對保守的單拷貝序列,尤其在親緣關系相近的物種間是保守的,而且在一些緊密相關的物種中其重復單位和重復次數具有一定的相似性。其次,這些小的、串聯排列的重復序列經常是通過核苷酸鏈的滑動錯配或者其它未知的過程來改變它們的長度,從而導
關于微衛星標記的基本簡介
微衛星DNA 是真核生物基因組重復序列中的主要組成部分,主要由串聯重復單元組成,每單元長度在1-10bp 之間,1 個SSR 的總長度可達幾十到幾百個bp。每個微衛星DNA 都由核心序列和側翼序列組成,其核心序列呈串聯重復排列。側翼DNA 序列位于核心序列的兩端,為保守的特異單拷貝序列,能使微衛
微衛星標記的概念和應用
微衛星DNA?是真核生物基因組重復序列中的主要組成部分,主要由串聯重復單元組成,每單元長度在1-10bp 之間,1 個SSR 的總長度可達幾十到幾百個bp。每個微衛星DNA 都由核心序列和側翼序列組成,其核心序列呈串聯重復排列。側翼DNA 序列位于核心序列的兩端,為保守的特異單拷貝序列,能使微衛星特
微衛星DNA的特點
⑴種類多、分布廣,并按孟德爾共顯性方式在人群中世代相傳。在基因組中平均50kb就有一個重復序列,突變率低(< 0.04%)。⑵在人群中高度多態,其多態信息含量容量超過70%。其多態性表現為正常人群的不同個體某一基因位點重復序列的重復次數可不一樣,同一個體的兩個同源染色體上重復次數也可以不一樣,即微衛
微衛星DNA的特點
⑴種類多、分布廣,并按孟德爾共顯性方式在人群中世代相傳。在基因組中平均50kb就有一個重復序列,突變率低(< 0.04%)。⑵在人群中高度多態,其多態信息含量容量超過70%。其多態性表現為正常人群的不同個體某一基因位點重復序列的重復次數可不一樣,同一個體的兩個同源染色體上重復次數也可以不一樣,即微衛
微衛星DNA的特點
⑴種類多、分布廣,并按孟德爾共顯性方式在人群中世代相傳。在基因組中平均50kb就有一個重復序列,突變率低(< 0.04%)。⑵在人群中高度多態,其多態信息含量容量超過70%。其多態性表現為正常人群的不同個體某一基因位點重復序列的重復次數可不一樣,同一個體的兩個同源染色體上重復次數也可以不一樣,即微衛
微衛星DNA分析技術
微衛星DNA(MicrosatelliteDNA),又稱為短小串聯重復(Shorttandemrepeats,STR)或簡單重復序列(Simplerepeatsequence,SRS或SSR),廣泛存在于原核生物和真核生物基因組中,常見的有二、三、四核苷酸重復序列,約占真核生物基因組的5%,其基本構
關于微衛星標記的相關特點介紹
SSR 操作簡單,僅需微量組織,即可使DNA 降解,進行有效地分析鑒定。其標記帶型簡單,記錄條帶一致,客觀明確,PCR 技術的利用,使微衛星標記技術實現操作自動化。 與其它標記技術相比,具有以下特點:首先,在每個微衛星DNA 兩端的序列多是相對保守的單拷貝序列,尤其在親緣關系相近的物種間是保守
細胞化學詞匯微衛星DNA
微衛星DNA,重復單位序列最短,只有1~6bp,串聯成簇,長度50~100bp,又稱為短串聯重復序列(Short Tandem Repeat STR)。廣泛分布于基因組中。 其中富含A-T堿基對,是在研究DNA多態性標記過程中發現的。1981年Miesfeld等首次發現微衛星DNA,其重復單位長度一
概述微衛星DNA的特點
⑴種類多、分布廣,并按孟德爾共顯性方式在人群中世代相傳。在基因組中平均50kb就有一個重復序列,突變率低(< 0.04%)。 ⑵在人群中高度多態,其多態信息含量容量超過70%。其多態性表現為正常人群的不同個體某一基因位點重復序列的重復次數可不一樣,同一個體的兩個同源染色體上重復次數也可以不一樣
微衛星DNA的基本介紹
微衛星DNA,重復單位序列最短,只有1~6bp,串聯成簇,長度50~100bp,又稱為短串聯重復序列(Short Tandem Repeat STR)。廣泛分布于基因組中。 其中富含A-T堿基對,是在研究DNA多態性標記過程中發現的。1981年Miesfeld等首次發現微衛星DNA,其重復單位長
微衛星DNA的分布情況
微衛星DNA又稱短串聯重復序列(shorttandemrepeat,STR)或簡單重復序列(simplesequencerepeats,SSR),廣泛隨機地分布于真核生物基因組中,在DNA序列中平均每6kb就可能出現一個,約占人基因組的10%,其基本構成單位(核心序列)為1-6bp,呈串聯重復排列而
關于微衛星標記的基本信息介紹
微衛星標記(microsatellite),又被稱為短串聯重復序列(short tandem repeats,STRs)或簡單重復序列(simple sequence repeats,SSR),是均勻分布于真核生物基因組中的簡單重復序列,由2~6個核苷酸的串聯重復片段構成,由于重復單位的重復次數
關于微衛星標記的實驗的步驟介紹
1. 客戶收集標本(血液或組織等標本)并提取DNA。 2. 設計引物序列并擴增,瓊脂糖電泳檢測結果。 3. 合成熒光標記引物。 4. 進行PCR擴增,產物通過測序儀器電泳檢測, 獲得擴增片段大小。 5. 分析測序儀器讀出的數據,給結果圖譜。
DNA標記
DNA標記(主要內容如下)??DNA Labeling by Nick Translation??Random Primed Labeling??End-Labeling??Purification of Labeled DNA??Non-isotopic Labeling??OthersDNA L
分子標記
內容:一、遺傳標記?二、DNA分子標記?三、染色體原位雜交?四、DNA分子標記的應用?長期以來,植物育種中選擇都是基于植株的表型性狀進行的,當性狀的遺傳基礎較為簡單或即使較為復雜但表現加性基因遺傳效應時,表型選擇是有效的。但水稻的許多重要農藝性狀為數量性狀,如產量等;或多基因控制的質量性狀,如抗性等
DNA分子標記技術研究進展(一)
遺傳標記在遺傳學的建立和發展過程中有著舉足輕重的作用,隨著遺傳學的進一步發展和分子生物學的異軍突起,遺傳標記先后相應地經歷了形態標記、細胞學標記、生化標記和DNA分子標記四個發展階段。前三種標記都是以基因表達的結果為基礎的,是對基因的間接反映;而DNA分子標記則是DNA水平遺傳變異的直接反映,它具有
DNA分子標記技術研究進展(二)
2.第二代分子標記2.1 SSR標記技術??? 在真核生物基因組中存在許多非編碼的重復序列,如重復單位長度在15~65個核苷酸的小衛星DNA(Minisatellite DNA),重復單位長度在2~6個核苷酸的微衛星DNA(Microsatellite DNA)。小衛星和微衛星DNA分布
微衛星DNA的研究和分布情況
微衛星DNA,重復單位序列最短,只有1~6bp,串聯成簇,長度50~100bp,又稱為短串聯重復序列(Short Tandem Repeat STR)。廣泛分布于基因組中。 其中富含A-T堿基對,是在研究DNA多態性標記過程中發現的。1981年Miesfeld等首次發現微衛星DNA,其重復單位長度一
微衛星DNA的結構和分布特點
微衛星DNA,重復單位序列最短,只有1~6bp,串聯成簇,長度50~100bp,又稱為短串聯重復序列(Short Tandem Repeat STR)。廣泛分布于基因組中。 其中富含A-T堿基對,是在研究DNA多態性標記過程中發現的。1981年Miesfeld等首次發現微衛星DNA,其重復單位長度一
微衛星DNA多態性的概念和應用
中文名稱微衛星DNA多態性英文名稱microsatellite DNA polymorphism定 義真核生物不同個體基因組中微衛星DNA短序列串聯重復拷貝數和核苷酸序列的差異。通常是設計引物用PCR去擴增微衛星DNA,所得產物再用限制性內切酶消化,電泳分析可以得到含不同長度DNA的圖譜。用于遺傳
分子標記的概念
分子標記(Molecular Markers),是以個體間遺傳物質內核苷酸序列變異為基礎的遺傳標記,是DNA水平遺傳多態性的直接的反映。與其他幾種遺傳標記——形態學標記、生物化學標記、細胞學標記相比,DNA分子標記具有的優越性有:大多數分子標記為共顯性,對隱性的性狀的選擇十分便利;基因組變異極其
分子標記的簡介
分子標記(Molecular Genetic Markers)是以個體間遺傳物質內核苷酸序列變異為基礎的遺傳標記,是 DNA 水平遺傳多態性的直接的反映。與其他幾種遺傳標記——形態標記、同工酶標記、細胞標記相比,DNA 分子標記具有的優越性有:大多數分子標記為共顯性,對隱性的農藝性狀的選擇十分便