顛覆傳統認知,表觀遺傳學之謎
盡管大多數生物體都是利用基因組上的甲基標記來監控基因表達,淡水原生動物Oxytricha trifallax卻利用這些標記踢走了垃圾DNA(95%的基因組序列)。這一研究發現駁斥了以往研究做出的通常攜帶四個細胞核的單細胞纖毛蟲無甲基化DNA的結論。 論文的第一作者、普林斯頓大學的博士后研究人員John R. Bracht, 說“因為以前從未有過報道,發現這里存在甲基化作用真是令人感到驚訝。在上世紀八九十年代大量的研究試圖尋找它但卻并未能找到。有趣的是你會在人類發現完全相同的修飾。但它可能發揮了不同的作用。” 普林斯頓大學進化遺傳學家、資深作者Laura Landweber 說Oxytricha具有特別奇特的生命周期,每個生物體都包含有兩種類型的細胞核:一種生殖系微核中裝著全部的基因組,但卻是轉錄沉默的;轉錄活躍的巨核中僅包含5%的基因組。Oxytricha通常攜帶著四個細胞核,每種類型兩個。 更......閱讀全文
細胞核基因組
每條染色體含1個DNA分子,1個細胞的全部遺傳信息(基因)都編碼在線狀的DNA分子上。由于每個體細胞中有2套染色體(2n),故所含的DNA是由兩個基因組(genome)構成。每個單倍體基因組約含3.2×109bp.人類基因的平均長度為1~1.5kb,所以基因組以足以編碼1.5×106蛋白質,但實
細胞核基因組——重復順序
高度重復順序其長度可能2、4、6、8等幾個bp,較長的順序可達200bp,但是重復拷貝數可達106次以上,例如染色體著絲粒、端粒和Y染色體長臂上的異染區就是由高度重復順序的衛星DNA構成的,高度重復順序不能轉錄,它們參與染色體結構的維持,形成結構基因間隔,可能與減數分裂時同源染色體的聯會配對有關
基因組DNA甲基化分析方法
早期的基因組DNA甲基化分析技術,如SssI甲基轉移酶分析法、氯乙醛反應法、免疫學抗體技術等,已經不能滿足現代表觀遺傳學研究的需求。今年來常用的基因組甲基化的方法有以下兩種。1. 甲基化敏感擴增多態性實驗甲基化敏感擴增多態性實驗技術被用于檢測雙向型真菌的DNA甲基化,它是在擴增片段長度多態性技術的基
甲基化的基因組直接測序法
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理,并以連接介導的PCR來放大信號強度,然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解,故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解
在基因組范圍定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳動物基因表達中扮演了重要角色。盡管通過線粒體遺傳且隨時間穩定,但是細胞分化、疾病或環境影響都會改變DNA甲基化的模式。近年來,科學家們開發出多種新方法,試圖在基因組范圍定位DNA甲基化。 盡管從理論上來說,全基因組亞硫酸氫鹽測序能讓研究人員全面觀察甲基化組,但它還是面臨技
家蠶基因組甲基化譜研究獲突破
我國科學家利用新一代測序技術構建家蠶絲腺甲基化譜 由中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院、西南大學、上海腫瘤所等合作的研究成果“家蠶基因組甲基化譜”,5月2日在國際著名學術雜志《自然—生物技術》(Nature Biotechnology)上發表,這是中國科學家
全基因組測序解讀重要甲基化機制
DNA看起來只是AGTC四種堿基的簡單排列,可一旦它與組蛋白包裝形成染色質,情況就復雜得多了。組蛋白主要有四種,分別是H2A、H2B、H3和H4。這些組蛋白要么令DNA盤繞起來保持沉默,要么將DNA解開允許基因表達。組蛋白上的化學修飾(如甲基化),能夠影響它對基因的控制。 H3K4me3是
線蟲基因組中存在DNA甲基化現象
2012年10月18日,吉林大學和華大基因合作完成的旋毛形線蟲不同發育階段DNA甲基化差異分析的相關研究成果在國際著名期刊《基因組生物學》(Genome Biology)上發表。該研究首次證實了線蟲基因組中存在DNA甲基化現象,改寫了長期以來認為線蟲中沒有該表觀遺傳修飾的歷史,同時也使以DN
全基因組甲基化定量檢測技術-LUMA
LUMA介紹基因組DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的變化被認為是正常和病理細胞過程中的重要的事件,有助于正常發育和分化以及癌癥和其他疾病。在此,我們介紹一種新的方法評估全基因組DNA甲基化,稱為熒光甲基化檢測(Luminometric Methylat
全基因組甲基化定量檢測技術-LUMA
LUMA介紹 基因組DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的變化被認為是正常和病理細胞過程中的重要的事件,有助于正常發育和分化以及癌癥和其他疾病。在此,我們介紹一種新的方法評估全基因組DNA甲基化,稱為熒光甲基化檢測(Luminometric Methyl