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  • 代謝組學、脂質組學在病毒研究中的應用(二)

    案例三基于代謝組學技術挖掘病毒感染宿主后代謝動態變化情況2019年發表在Viruses雜志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶標和靶標代謝組學方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆蟲Bm5細胞后宿主代謝的動態變化情況。研究人員發現,CrPV感染導致Bm5細胞的代謝具有顯著和特定階段的變化。比如,CrPV持續感染過程中葡萄糖和谷氨酰胺水平均顯著升高,隨后在致病期急劇下降。不同代謝產物的豐度和途徑分析進一步確定了病毒生命周期不同階段的特定代謝特征。為病毒感染宿主后的致病過程,疾病分期,以及藥物治療效果提供理論依據。新興傳染病往往是人畜共患疾病,可以從動物傳播給人類。通過蛋白、代謝和脂質等多組學技術可以幫助研究者還原宿主-病原體相互作用關系,從而為醫務人員和科研工作者提供理論依據。Orbitrap技術作為蛋白質組學的金標準,其高靈敏度、高精度,高通量等特性在代謝組學和脂質組學......閱讀全文

    代謝組學、脂質組學在病毒研究中的應用(二)

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    代謝組學、脂質組學在病毒研究中的應用(一)

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    LCMS在脂質組學中的應用

      脂質組學(lipidomics)已經作為一門獨立的學科與非靶代謝組學、靶向代謝組成為代謝組學中“三大主要研究領域”。為什么脂質組學會成為研究熱點中的新寵?請聽我一一道來。  還記得上面這張18年初風靡全生物圈的“小鼠拔罐”圖嗎?今年2月,陸軍軍醫大學新橋醫院李詠生團隊發表在【Cellular P

    【JOAT劉虎威編者按】專題:代謝組學和脂質組學

      劉虎威教授擔任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主編。     近日,劉虎威教授擔任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主編進行了約稿審稿工作,并撰寫了題為“專題:代謝組學和脂質組學”的編者按。  代謝

    代謝及脂質組學液質應用培訓班通知

      基于質譜的代謝組學已成為疾病機理研究、臨床生物標志物發現、新藥靶點開發、環境暴露、食品真偽或溯源、農業和林業科學等方面的重要科研手段而被廣泛應用。為了助力代謝組學領域的質譜學者更好地運用LC-MS/MS系統進行研究,SCIEX將在天津舉辦“代謝及脂質組學液質應用培訓班”,內容主要涉及:  1)代

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    代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹

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    質譜在組學中的應用

    質譜在組學中的應用無疑是當前最熱門的,而且各種組學都廣泛深入的得到了開展。這其中有一些比較有特色的應用領域,最近十分熱門,它們前景如何?技術瓶頸在哪里?市場推廣還有哪些問題,值得相關專業人士思考。??? ? 質譜成像技術(Imaging MS)誕生了近20年,最早主要是在二次離子質譜(SIMS)領域

    代謝組學技術在臨床醫學中的應用

      代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新發展起來的一門學科,它通過對人體內小分子代謝物(50~1,500 Da)進行精準定性定量,分析代謝物與人體生理病理變化的關系,研究疾病發生發展、尋找疾病生物標記物、預測疾病預后等。代謝組學在臨床診斷上將有廣闊的發展前景,主要應用方向有四個方面:在臨床診斷(B

    PNAS脂質組學揭示病毒感染引起的脂代謝異常潛在治療靶

      關鍵詞:埃博拉病毒,脂質組學,治療靶點,脂質代謝   2014年,非洲爆發了有史以來最兇猛的一次埃博拉病毒疫情,震動全球。直到年底,疫情才終于得到控制。根據世衛組織的統計數字,截至2014年12月14日,全球范圍內已有超過1.8萬例感染者,近7000人死亡。因為疫情影響農業生產和貿易,西非疫區

    代謝組學的研究方法

    代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色譜-質譜聯用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜

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    綜述:代謝組學在疾病中的應用

       代謝組學經歷了迅猛的技術演化在過去二十年。尤其是廣泛靶向代謝組學技術的新起,實現一次性檢測堅定上千種物質,同時能夠定量。整合了非靶向和靶向代謝物檢測技術的優點,創造性實現了高通量、高靈敏度靶向代謝物檢測,為定性、定量檢測大批量、低豐度代謝物提供了高效的方法。   應用代謝組學的定義事件的預測生

    【網絡研討會】蛋白質組學/脂質組學研究進展

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    高分辨質譜脂質輪廓譜表征用于食品組學研究中...(二)

    3.2 分類與多元統計結果實驗挑選 6 種最為常見的食用植物油進行深度的多元統計分析。圖 5 為對 SIEVE 軟件獲得的脂質輪廓譜數據矩陣進行聚類分析的結果,可見, 6 種食用植物油樣品按照各自的植物基源,分類明確。隨后,為進一步明晰不同脂質分子在脂質整體輪廓分類中的貢獻,實驗又對這 6 種植物油

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    代謝組學在中藥動態代謝和相互作用過程研究中的應用

    賈偉教授團隊近年來建立了基于代謝組學策略的藥物動力學新方法,在分子水平上刻畫包括復方中藥和天然產物在內的多成分藥物(Multi-component Agents)在體內的整體、動態的代謝和相互作用過程。最近該團隊與上海中醫藥大學劉平教授團隊合作,采用高通量代謝組學平臺以及所建立的多組分藥物生

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    代謝組學——腫瘤研究的利器

      細胞內許多生命活動是發生在代謝物層面的,代謝物更多地反映了細胞所處的環境,比如細胞現在是不是健康?藥物是否起效?環境污染物是不是正在傷害細胞?等等。由此,20世紀90年代,衍生出了一門新學科:代謝組學。它回答了基因組學和蛋白質組學不能回答的問題:細胞到底發生了什么?  1、腫瘤與代謝組學  腫瘤

    做好代謝組學研究的關鍵

    首先明確代謝組學的核心任務。對小分子代謝物的定性、定量分析并發現差異代謝物:(1)對生物體系中的內源性代謝物及其變化規律進行表征;(2)以差異代謝物作為核心對生命奧秘進行解析。而基于色譜/質譜聯用的分離分析技術具有靈敏度高、選擇性好、動態范圍寬、信息豐富等優點,已成為代謝組學研究的主流技術平臺。其次

    蛋白質組學在病原體學研究中的應用

      最近,《Molecular & Cellular Proteomics》期刊兩篇文章分別報道了一種性傳播寄生蟲“陰道毛滴蟲(Trichomonas vaginalis)”和HIV相關機會肺真菌“曲霉菌(Aspergillus)”的致病機理。  文章一、脂肪酸讓寄生蟲如虎添翼  根據疾病控制和預防

    布魯克最新發布-|-4D代謝組學和4D脂質組學新突破

      新型VIP-HESI離子源將4D-代謝組學、4D-脂質組學和小分子定量篩選工作流程的靈敏度提高了10倍以上;  數據庫全新發布包含CCS值的代謝物數據庫METLIN-4D;  數據處理軟件集成了代謝物CCS值預測功能CCS-Predict Pro;  新款代謝組學軟件MetaboScape 20

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