1.新鮮組織樣本
新鮮組織一般包括以人類疾病診斷及治療為目的，經患者或健康人同意后，從患者的機體中切取的未經特殊化學試劑處理的病變組織或相鄰健康組織，或者健康人的相同部位的對照組織。這些人類疾病相關的新鮮組織樣本的整理、保存、研究對于提高疾病的診斷質量、促進臨床工作、探討及研究疾病的發病機制具有重要的意義。此外，新鮮組織樣本還包括從其他物種的機體中切取的未經特殊化學試劑處理的樣本。采用新鮮組織樣本，并使用Agilent miRNA芯片，可以對新鮮樣本的miRNA表達譜進行及時直接的監測，從而對疾病，或者動植物的不同發育階段，不同器官的miRNA表達譜進行研究，了解miRNA的表達趨勢變化，和相應的功能。上海伯豪生物技術有限公司為客戶提供了多年優質的Agilent miRNA芯片服務，發表了一系列相關論文。
伯豪案例選摘：
肺癌組織樣本：
Huang W, Hu J, Yang DW, Fan XT, Jin Y, Hou YY, Wang JP, Yuan YF, Tan YS, Zhu XZ, Bai CX, Wu Y, Zhu HG, Lu SH. Two MicroRNA Panels to Discriminate Three Subtypes of Lung Carcinoma in Bronchial Brushing Specimens. Am J Respir Crit Care Med2012 Dec 1;186(11):1160-7.
大腸癌組織樣本：
Wang S, Wang L, Bayaxi N, Li J, Verhaegh W, Janevski A, Varadan V, Ren Y, Merkle D, Meng X, Gao X, Wang H, Ren J, Kuo WP, Dimitrova N, Wu Y, Zhu H. A microRNA panel to discriminate carcinomas from high-grade intraepithelial neoplasms in colonoscopy biopsy tissue. Gut. 2013 Feb;62(2):280-9.
腎細胞癌組織：
Chen X, Wang X, Ruan A, Han W, Zhao Y, Lu X, Xiao P, Shi H, Wang R, Chen L, Chen S, Du Q, Yang H, Zhang X. miR-141 Is a Key Regulator of Renal Cell Carcinoma Proliferation and Metastasis by Controlling EphA2 Expression. Clin Cancer Res. 2014 20: 2617-30.
子宮頸癌組織：
Ke G, Liang L, Yang JM, Huang X, Han D, Huang S, Zhao Y, Zha R, He X, Wu X. MiR-181a confers resistance of cervical cancer to radiation therapy through targeting the pro-apoptotic PRKCD gene. Oncogene 2013 Jun 20;32(25):3019-27.
大鼠神經組織：
Yu B, Zhou S, Wang Y, Qian T, Ding G, Ding F, Gu X.miR-221/222 promote Schwann cell proliferation and migration by targeting LASS2 following sciatic nerve injury. J Cell Sci. 2012 Jun 1;125(Pt 11):2675-83.
小鼠大腸癌模型組織：
Gao Y, Li X, Yang M, Zhao Q, Liu X, Wang G, Lu X, Wu Q, Wu J, Yang Y, Yang Y, Zhang Y. Colitis-Accelerated Colorectal Cancer and Metabolic Dysregulation in a Mouse Model. Carcinogenesis. 2013 Aug;34(8):1861-9.
2.FFPE樣本
使用芯片技術研究miRNA通常需要使用新鮮的樣本或快速冷凍的樣本。但是世界上大約有數十億份組織樣品保存在醫院或者組織樣品庫中，絕大多數是使用福爾馬林固定石蠟包埋的方法處理(Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded，FFPE)的樣品。數量巨大的樣品蘊含著無限的科學研究的機會同時也是研究者們很棘手的研究對象。如何從這些樣品中獲取我們需要的生物信息呢？ Queen’s Cancer Research Institute的研究者使用Agilent miRNA芯片對快速冷凍的樣本以及與之相匹配的相應的FFPE樣本進行了研究。 結論證實：檢測FFPE樣本中的miRNA在技術上是可行的；Agilent miRNA芯片平臺的數據顯示出其在抽提、標記和雜交過程中的高度重復性。
利用Agilent miRNA芯片可以對FFPE樣本進行miRNA的表達譜研究，為挖掘FFPE樣本的巨大應用價值提供了新的方法。
伯豪案例選摘：
Fang Y, Yu X, Liu Y, Kriegel AJ, Heng Y, Xu X, Liang M, Ding X. miR-29c is downregulated in renal interstitial fibrosis in humans and rats and restored by HIF-α activation. Am J Physiol Renal Physiol. 2013, 304(10):F1274-82.