13 或許是因為LbuC2c2的特異性和非特異性剪切活性遠遠高于LshC2c2的相應活性, Doudna團隊意識到LbuC2c2可以被用來構建高特異性、高靈敏度的RNA檢測方法。若想檢測出某一特定序列的RNA分子，先將與其互補的crRNA和LbuC2c2蛋白組裝，再加上一些報告RNA分子。常用的一種報告RNA是一段寡核苷酸：一端附有一個熒光素（F），另一端有一個暗淬滅劑（Q）。由于猝滅作用，一個完整的報告RNA分子不會發出熒光。當LbuC2c2-crRNA抓到特定的靶RNA（activating target RNA）時，LbuC2c2的非特異性RNA水解酶的活性被激活，剪切報告RNA，其熒光素擺脫了Q的淬滅，釋放出熒光。這樣，通過熒光信號就可以檢驗出靶RNA的存在。Doudna團隊用這個方法成功地檢測出噬菌體的RNA（右圖中的l2, l3和l4），靈敏度達到0.01nM。
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C2c2或Cas13a系統的高度特異性取決于Cas13a-crRNA對靶RNA的識別，而高靈敏度則來自激活后的Cas13a的非特異性RNA酶活性——一個被激活的Cas13a分子可以迅速剪切大量報告RNA分子。在沒有靶RNA分子的條件下，沒有配對成功的Cas13a-crRNA就保持沉默，不會亂砍亂殺。CRISPR分子診斷技術的（剪切式）機理初步建立起來。
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15 這段時間張鋒團隊也沒閑著。他們又用”釣魚”的方法尋找新的不含Cas1的CRISPR系統。這次他們在基因庫里先撒網找到CRISPR array，再把附近的基因一塊兒撈上來。他們發現了Cas13b, 另一個靶向RNA的效應/干擾酶。此外，他們還發現了兩個輔助蛋白：Csx27和Csx28——前者抑制Cas13b的活性，而后者則加強它的活性。Cas13b的發現為以后設計多重診斷提供了一個額外的工具。這部分結果于2017年1月發表在Molecular Cell上。
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16 僅過了3個月，張鋒團隊又在Science上發表了一篇里程碑式的論文，標志著CRISPR分子診斷技術的正式建立。他們在Cas13a系統的基礎上，又引入了DNA常溫擴增技術——RPA，創造了新的技術平臺——SHERLOCK技術。待檢驗的核酸分子，如果是DNA，就先通過RPA擴增，如果是RNA，則通過RT-RPA擴增。擴增后的DNA產物再通過轉錄變成RNA分子。靶RNA的檢測最后通過Cas13a-crRNA和報告RNA來完成。SHERLOCK的名字除了是這一技術的英文縮寫外，還暗指傳奇偵探夏洛克.福爾摩斯。用SHERLOCK檢測特定的核酸分子，就好像福爾摩斯的偵探工作一樣，即使是大海撈針的問題，也會迎刃而解。
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RPA技術是由英國科學家Niall
Armes于2006年發明的。RPA和PCR功能一樣，都是指數式擴增DNA分子。但與PCR不同的是，RPA技術不需要經過溫度變化的周期。DNA模板雙鏈變單鏈、引物結合、與延伸合成全都在重組酶、單鏈結合蛋白等輔助下進行。DNA擴增在一個溫度（通常為體溫）下即可完成。因此，RPA的一個巨大優勢就是不需要特殊的設備，比如PCR儀。RPA技術也被單獨應用到分子診斷領域，但因為其靈敏度不如qPCR或digital
PCR（ddPCR）高，所以一直沒有騰飛——直到張鋒團隊把它和CRISPR結合起來。
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18 許多診斷應用的靈敏度都需要達到渺摩爾（attomolar, aM或10-18M）。有了RPA擴增這一步，SHERLOCK檢測RNA（左圖）或DNA（右圖）的靈敏度大大增加，能夠測到渺摩爾濃度的靶分子。也就是說，1微升里有一個靶DNA或RNA分子都可以檢驗出來（10-18M x 10-6L x 6.02 x 1023 molecules/mole < 1 molecule）。實現CRISPR診斷應用的最主要的一個障礙被解除了。除了增加RPA這一步，張鋒團隊把LshCas13a更換成LwCas13a也對提高靈敏度起到了一定作用。經過進一步摸索，SHERLOCK的所有反應都可以在一個溶液中完成，甚至能將所有試劑變成凍干粉固定在試劑紙上，也不大影響檢測的靈敏度。
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