轉座子廣泛存在于生物的基因組中,能夠自我復制,并隨機插入到染色體上,因此又被稱為跳躍基因。轉座子在生殖細胞中特別危險,可能導致不孕或對后代發育產生嚴重影響。在進化過程中,復雜生物形成了一套生殖細胞基因組的防御機制,這一機制被稱為piRNA通路。
冷泉港實驗室(CSHL)Gregory Hannon教授領導的研究團隊對piRNA通路進行了研究。他們在雌性果蠅的卵巢中,鑒定了參與轉座子抑制的一系列基因,獲得了piRNA通路核心元件的綜合列表。文章發表在Cell旗下的Molecular Cell雜志上。
動物的piRNA通路包括Piwi蛋白家族和小RNA分子(即piRNA)。自2006年發現piRNA以來,人們一直試圖了解這些RNA如何產生又怎樣發揮功能。此前,科學家們已經鑒定了piRNA通路中的一些重要成員,但該通路中還有許多成員是未知的。
“我們鑒定了piRNA通路發揮正常功能所必需的大量基因,并對其中一些進行了深入研究。”Hannon說。這項研究增進了人們對piRNA通路的理解,為解析整個轉座子抑制機制提供了基礎。
研究人員認為,這些發現可以幫助人們在體外重建piRNA通路,以便深入理解細胞選擇性沉默基因的具體機制。在此基礎上,人們有望開發新療法,治療與基因功能異常有關的復雜疾病,例如癌癥和精神分裂癥等。
這項研究在果蠅體內進行,因為它們具有人類生殖細胞防御系統的全部基本元素。研究人員在雌性生殖細胞和濾泡細胞(源自體細胞)中,通過RNA干涉(RNAi)對大量基因進行了篩選。為了分析單個基因對轉座子水平的影響,他們在雌性生殖細胞中,一一下調了在卵巢表達的8000個基因,并用同樣的方法在濾泡細胞中分別下調了果蠅基因組的全部13,900個基因。
在此基礎上,研究人員鑒定了大量參與轉座子抑制的基因,并選取影響最大的基因進行深入研究。研究顯示,抑制asterix基因會使gypsy轉座子的水平顯著升高。當asterix基因被下調時,gypsy轉座子活化,先生成一段RNA。正常情況下,Piwi蛋白與小RNA形成的復合體,能夠識別該RNA序列,并使轉錄過程停止。
研究顯示,piRNA使包裝gypsy DNA的組蛋白發生化學修飾(H3K9三甲基化),以此給gypsy打上“沉默”標簽。這時基因表達系統無法接觸gypsy,使其保持在休眠狀態。如果缺乏asterix,gypsy就可以開始轉錄,轉座子得以擴散。
研究人員發現,一些在生殖細胞抑制轉座子的基因,也在濾泡細胞中發揮同樣的作用,說明它們是“核心piRNA通路”中的成員。在果蠅的生殖細胞中,可能活躍的轉座子約有80 -100個,比濾泡和其他體細胞多得多。因此雌性生殖細胞中的piRNA機制更為精密,轉座子的抑制系統包括更多的基因和輔助蛋白。
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