一、從瓊脂糖介質中純化DNA片斷
1. 用低熔點或常規熔點瓊脂糖電泳對PCR擴增片斷進行分離，該電泳安常規方法進行，緩沖液為TAE。
2. 在凝膠上，找到所需條帶，然后用潔凈并滅菌的小刀將其切下接近300微升瓊脂糖凝膠 （約300毫克）
3. 如果切下的瓊脂糖為高融點的則安下面A步驟進行，如為低融點瓊脂，則安B步驟進行。
A. 將300微升瓊脂塊放進1.5毫升的微量離心管中，加入1毫升純化用樹脂，然后將其置于65℃水浴保溫5分鐘，或保溫至瓊脂完全溶解。
B. 將300微升瓊脂塊放進1.5毫升的微量離心管中，然后將其置于70℃水浴保溫至瓊脂完全溶解，然后加入1毫升純化用樹脂到融化好的瓊脂中，將其混合20秒，但不要振動。
4. 為每一個待回收片斷準備好一個微量柱。 在每個柱的開口處，聯上一針筒，然后將這些柱與針筒的復合體與抽真空設備相連
5. 在柱-針筒復合體中加入樹脂/DNA混合物，打開真空裝置，將樹脂與DNA的混合物抽到微量柱中，斷開真空裝置與柱的連接。
6. 洗柱，加入2毫升80%的異丙醇，打開真空裝置，使這些洗柱液完全流經微量柱。
7. 繼續真空30秒以干燥樹脂，注意此干燥時間不能超過30秒。關閉真空，移去針筒。將微量柱轉移至一1.5毫升微量離心管中。10 000 g 離心2分鐘，以徹底除去殘存的異丙醇。
8. 將微量柱，再轉移至一新的1。5毫升微量離心管中，加入50微升水或TE緩沖液，靜置1分鐘（在頭30秒，DNA仍將吸附于柱上）， 10 000 g 離心20秒，以洗脫DNA片斷，所得純化后的DNA片斷可直接用于連接反應或在-20℃保存。
二、尿素丙烯酰胺變性膠中分離DNA片斷
1. 從變形膠上切下待回收片斷，將其放如一微量離心管中。
2. 加入100微升TE緩沖液，37℃保溫30分鐘以上。
3. 將上清液吸入一新管中，加入1毫升樹脂，振蕩20秒以混勻樹脂與清液。
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