由于KBr其良好的紅外光透過特性，FTIR干涉儀采用KBr作為分束器材料。但是其最大的缺點就是怕潮，很容易潮解。因此干涉儀的防潮是非常重要的一項措施。島津公司在FTIR干涉儀防潮設計上是領先的。其在1984年就設計了世界上第一款密封干涉儀的FTIR-4000，在2002年和2008年又分別推出了配備自動除濕器的IRPrestige-21和IRAffinity-1，是世界獨一無二的設計。
圖4. 自動除濕器原理示意圖
島津公司FTIR的干涉儀除濕器設計是不一樣的，如IRPrestige-21采用的帕爾貼的原理。當有電流通過熱電材料時，其溫度下降，干涉儀內部的水汽會凝結在冷卻板上面，然后導流到吸濕材料上，并排除干涉儀內部。IRAffinity-1采用的是電極的設計。干涉儀內部的陽極將水分子分解：
除濕器的耗電量很低，只需要4.5VA，在待機電力下就可正常工作。大大減輕了干涉儀的干燥維護工作。
此外，其它的保護干涉儀分束器的技術得到了廣泛應用，如在KBr上鍍Ge，使用硅膠除濕，密封干涉儀，使用防水的KRS-5窗片等。
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