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  • 發布時間:2020-04-18 19:59 原文鏈接: FastDNA試劑盒及具體實驗流程步驟

    FastDNA 試劑盒可從廣闊的各種來源中快速有效地分離出 genomic DNA,配套 FastPrep 儀器使用。動植物組織、細菌、海藻、真菌和其他許多標本,在 40 秒內容易被裂解。這個 benchtop 設備是一種ZL性的垂直角度運動,這種運動使得裂解微粒能同時從多方向、同步地碰撞。

    FastPrep 儀器提供一種極其快速、有效、高度可重復勻質化,超過了用酶消化、超聲破碎儀、渦旋、混合傳統提取方法。標本放在裝有 Lysing Matrix A 的 2.0 ml 試管中。同時幾乎全部的標本很容易用預先填充化合物進行加工,另外,1/4 英尺的陶球用來加工堅硬的標本,比如:骨頭、軟骨和種子。在有 CLS 專樣下,用 Lysing Matrix A 處理,在 FastPrep 儀器中將會勻漿化。對植物組織來說, CLS-VF 用來和 PPS 連用。酵母、海藻和真菌在CLS-Y 中被裂解。CLS-TC 是用來裂解其他所以標本。為了獲得最大的柔韌性,試劑會提供所有的緩沖液。裂解之后,標本被離心到 pellet debris 和 lysing matrix。通過硅土基質 GENECLEAN 程序 DNA 被純化。提取的 DNA 準備用來消化、電泳、PCR 和其他任何期望的用途。

    適用研究范圍:

    動植物組織、細菌、酵母、藻類和真菌中分離基因組試劑盒 

    試劑盒組成:

    品名 規格
    Lysing Matrix A 100*2 ml tubes
    1/4 Ceramic Spheres 100 spheres
    Binding Matrix 66 ml
    Concentrated SEWS-M 12 ml
    DES 25 ml
    CLS-VF 90ml
    PPS 25ml
    CLS-TC 110ml
    CLS-Y 110ml
    User manual 1 each
    MSDS 1 each
    Certificate of Analysis 1 each

     
    實驗者需自備的儀器及耗材
    FastPrep? Instrument (fastprep 儀器)
    Microcentrifuge that can freely spin 2.0 ml tubes (可裝載 2.0ml 管子的離心管) Microcentrifuge tubes (2.0 ml and 1.5 ml) (可裝載 1.5 和 2.0ml 管子的微型離心管) Rotator or low-speed vortex
    (Optional) SPIN Filters and Catch Tubes, 100
     
    操作步驟
    1. 添加標本到 Lysing Matrix A 管中。
    在水中或者是等滲鹽溶液中,放置 100-200 mg 組織(新鮮、冰凍、干燥等)或者200μl細胞懸浮
    液。對于細菌、酵母、海藻、或者是組織培養細胞是在懸浮液中生長,離心充足的培養體積,以便提供 50-100 mg 濕重的小球尺寸的標本。(在水或者等滲鹽溶液中重新懸浮小球,獲得 200 μl 的最大懸浮體積。)
     
    2. 根據下表添加適當的 CLS。 

    Processing Tissue From: Add to Sample Tube:
    Plant tissue 800μl CLS-VF and 200 μl PPS
    Animal tissue, cultured cells, insects,
    bacteria, bone, etc.
    1.0 ml CLS-TC
    Yeast,algae or fungi 1.0 ml CLS-Y


    3. 在 FastPrep 儀器中用 6.0 設置的速度勻質化 40 秒鐘。

    4. 以 14,000 轉離心 5-10 分鐘到 pellet debris。


    5. 轉移 600 --700μl 的懸浮液到一支 2.0 ml 微型離心管,加同等體積的Binding Matrix, 顛倒混勻。
    注釋:在和下步之間,全部體積的完全混合,使用一支足夠大的試管來提供空間是很重要的。不建議使用圓錐底的試管。在這步一支 2.0 ml 微型離心管就足夠了。

    6. 在室溫的條件下,攪拌器一般攪拌 5 分鐘進行孵育。 
    注釋:一臺低速的旋渦機在這步可以用,但是操作必須小心,以免除去 DNA。

    7. 在 14,000 轉離心 10 秒鐘到pellet Binding Matrix,去除上清液(懸浮液)。

    8. 添加 500μl 備好的 SEWS-M,用吸量管輕輕地吹動液體的力量使小球重新懸浮。
    注釋:確保酒精加到濃縮的,參看 3.1 部分。

    9. 14,000 轉離心 1 分鐘,去除上清液。
    注釋:用旋轉式移液器轉移重新懸浮的Binding Matrix 到另一只旋轉式移液器。用 14,000 轉離心 1 分鐘,去除槍頭管里的物質。

    10. 用 14,000 轉離心 10 秒鐘,用小的吸量管移動剩余液體。
    注釋:如果用一支,用 14,000 轉離心第二次,用新的干凈的試管替代 the Catch Tube。 

    11. 在 100μl 的 DES 中,通過輕輕地重新懸浮的Binding Matrix 洗提 DNA。
     
    12. 用 14,000 轉離心 1 分鐘,轉移洗提的 DNA 到干凈的微型離心管中。DNA 可為下游應用作準備。為延長有效期將它存儲在-20°C 或者是 4°C,直到使用。
    注釋:用一支吸量管小心轉移DNA,以避免轉移帶有洗提 DNA 的 Binding Matrix 微粒,避免 shearing。注釋:用 SPIN 移液器,在 14,000 轉離心 1 分鐘,將洗提的DNA 放入干凈的catch tube。DNA 可為下游應用作準備。為延長有效期將它存儲在-20°C 或者是 4°C,直到使用。


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