NgAgo能夠超越CRISPR嗎?不止國內,有些老外也比較關注這個問題。世界上做基因組編輯方法和應用的實驗室,差不多都有CRISPR-Cas9的成熟技術平臺。CRISPR-Cas9編輯系統是已得到大家承認的成熟基因組編輯工具,而且CRISPR技術的優勢不可小覷,有大牛撐它,它的發展和完善幾乎匯聚了全世界基因組編輯實驗室的資源,過去幾年的發展速度令人驚嘆。
NgAgo 能夠后來居上,超越 CRISPR嗎?
從寫個人主觀評論的數量上來看,國外對NgAgo 的關注,感覺上似乎并沒有國內這么熱。簡單搜列了一下,發現大多數評論都是客觀地描述文章的結果或平行介紹NgAgo 和 CRISPR原理,帶有個人主觀色彩的評論不是特別多。下面摘錄、整理、加工一些帶有個人主觀色彩的評論。David在其評論中認為,這是一個有趣的編輯系統,文章也值得一讀,對于編輯效率,雖然缺乏嚴格的比較,但從文章給出的信息來判斷,NgAgo和Cas9在編輯效率上應該是同級別的,至于NgAgo 能否替代 CRISPR,仍不能確定,唯一能確定的是這絕不是基因編輯的最后進展。
Paul在其評論中給出的答案是:從任何角度,暫時都沒有可能——“not going to immediately race ahead of CRISPR…not yet any way”,但他不得不承認NgAgo確實引起了人們的高度關注。他援引了韓春雨文章總結的4個特點,如果誠如文章所述的4點,那么NgAgo可能會比CRISPR更簡潔,而且按照韓文章圖5,NgAgo編輯效率確實有點牛。
不過,他認為因為CRISPR已有大量的文章支持,所以NgAgo僅憑這篇文章還遠遠不能說明問題,對NgAgo的定論還得需要更多的文章和數據。讀起來讓人隱隱覺得有一種“too good to be true”的酸味道。最后,他說讓我們來圍觀吧,接下來的幾個月肯定會有大量井噴的后續文章。
于是,圍觀的家伙們真的來了——
路人甲——鹿死誰手,尚未可知,但大家要在公平的環境里競爭啊。(一看就是通曉業內潛規則的家伙,那么多做CRISPR的大牛,看來NgAgo的前景不妙啊,所以你們拉開場子打架可以,但要公平!公平!公平!)
CRISPR的死忠也來了,針對韓文章總結的4點一一開展了抨擊——筆者絕不是瞎掰啊,筆者是根據Betteridge’s law(該法則意思是對于任何以問號結尾的問題,都可以用no來回答)對NgAgo說no:
(1)Church實驗室的iPSC基因組測序結果說明CRISPR對錯配也有Low tolerance;
(2)誤導(misguiding)?這是我聽到基因組工程問題中最滑稽的命題,而且磷酸化的ssDNA那根本就不叫DNA好不好,那只能是看做對DNA破壞或感染,這兩者(DNA damage 和DNA infection)對基因組操作來說都是不受歡迎的;
(3)我從來不記得有人真正看到過sgRNA從Cas9中被替換出來,有木有?
(4)誰說sgRNAs不好設計和合成?說這話的肯定是沒做過基因組編輯的;
(5)樓主你別幫人家瞎吹行不?我看圖5中對HEK293T細胞的編輯效率低到不行,好不好?
路人乙——你不覺得這工具很牛掰,可以用來編輯成年人的基因么?(這腦洞開得有點大)
路人丙——你不覺得不需要PAM是個優點么?鄙人認為還未建立CRISPR平臺的實驗室和公司,選擇NgAgo未嘗不是一件好事。不過,從“前浪紛紛被后浪拍死的”節奏看,基因組編輯的發展速度令人眼花繚亂,NgAgo絕不會是最后的工具,我賭更好的工具最快年內就會出來。你賭不?兩本閣樓雜志!
路人丁——你們這些傻X,為什么非要從自然界中找酶基因,難道你們不知道人工設計的酶更牛掰N倍么?我堅信最后終結你們這些浪費納稅人錢的,一定是人工設計出來的酶。(很憤青的樣子)
路人午——對于投資了大量時間和資源在CRISPR上面的,不會輕易轉到NgAgo上面,除非碰到100%不能解決PAM問題的情況,可能會嘗試一下NgAgo。(貌似比較理性)
路人X——5′-P ssDNA不能通過質粒產生,意味著不能用質粒或病毒傳遞,只能合成和轉染,轉染是不可控的,這是NgAgo的一個大問題。(貌似很專業的樣子)
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