針對16S rRNA 保守序列設計引物，通過 PCR 擴增，可以將牛奶中嗜冷菌擴增出147bp的 DNA片段，標記后用 ELISA 檢測，得到熒光假單胞菌AH-70 的OD450和菌濃度的方程，分析得此方法和平板計數法的相關系數達到 0.94，可以檢測菌濃度范圍是103-107CFU/mL。PCR 檢測具有很高的靈敏度，特異性較強，有文獻報道當原料奶中埃希腸桿菌的濃度達到 10CFU/mL 時能被檢測出來。PCR 檢測菌落數結果同樣會受到死菌株數的影響，而且在現實生產中對食品提取可以PCR擴增的DNA難度很大，容易被食品體系中因素影響精確度。
